More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5095 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  62.63 
 
 		 572 aa  728    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  57.81 
 
 		 577 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  62.81 
 
 		 572 aa  728    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  62.81 
 
 		 572 aa  728    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  71.7 
 
 		 572 aa  839    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0611  pyruvate dehydrogenase  74.17 
 
 		 576 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.69435  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1650  pyruvate dehydrogenase  74.17 
 
 		 572 aa  820    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  70.47 
 
 		 601 aa  824    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  58.06 
 
 		 576 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  81.15 
 
 		 573 aa  957    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  62.46 
 
 		 572 aa  723    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  62.63 
 
 		 572 aa  728    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  62.81 
 
 		 572 aa  728    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0699  pyruvate dehydrogenase  74.52 
 
 		 572 aa  824    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2858  pyruvate dehydrogenase  80.98 
 
 		 573 aa  951    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  57.44 
 
 		 578 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2219  pyruvate dehydrogenase  74.52 
 
 		 572 aa  824    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.372281  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  80.98 
 
 		 573 aa  952    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  62.63 
 
 		 572 aa  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  62.81 
 
 		 572 aa  728    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  57.44 
 
 		 576 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  65.21 
 
 		 575 aa  776    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  66.14 
 
 		 573 aa  757    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  62.81 
 
 		 572 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2374  pyruvate dehydrogenase  83.94 
 
 		 573 aa  990    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  100 
 
 		 573 aa  1177    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  62.98 
 
 		 572 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  57.34 
 
 		 574 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2302  pyruvate dehydrogenase  74.17 
 
 		 572 aa  820    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  56.7 
 
 		 577 aa  684    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4792  pyruvate dehydrogenase  81.15 
 
 		 573 aa  954    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  62.81 
 
 		 572 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  81.5 
 
 		 573 aa  959    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  62.81 
 
 		 572 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  57.52 
 
 		 576 aa  696    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  62.87 
 
 		 572 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  54.66 
 
 		 571 aa  641    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3376  pyruvate dehydrogenase  81.15 
 
 		 573 aa  954    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  59.3 
 
 		 577 aa  686    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  66.67 
 
 		 573 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  62.63 
 
 		 572 aa  728    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  62.81 
 
 		 572 aa  728    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3833  pyruvate dehydrogenase  64.5 
 
 		 583 aa  696    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1728  pyruvate dehydrogenase  73.99 
 
 		 576 aa  818    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4864  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  59.65 
 
 		 575 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.662059  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  66.49 
 
 		 573 aa  754    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1935  pyruvate dehydrogenase  74.17 
 
 		 572 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.935279  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  75.09 
 
 		 574 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  81.5 
 
 		 573 aa  960    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  56.7 
 
 		 577 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  66.67 
 
 		 573 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  55.54 
 
 		 578 aa  630  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  51.74 
 
 		 579 aa  578  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  50.09 
 
 		 578 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  48.36 
 
 		 591 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0367  pyruvate dehydrogenase  48.16 
 
 		 579 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  46.91 
 
 		 572 aa  527  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3808  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  48.1 
 
 		 582 aa  521  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  48.28 
 
 		 582 aa  519  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  48.01 
 
 		 582 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  44.64 
 
 		 579 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9103  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  49.74 
 
 		 577 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  46.77 
 
 		 572 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  45.3 
 
 		 588 aa  496  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3196  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  46.42 
 
 		 589 aa  492  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000534651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  42.56 
 
 		 578 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 578 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.21 
 
 		 578 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6071  pyruvate dehydrogenase  46.25 
 
 		 572 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 576 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1010  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  42.71 
 
 		 573 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0972  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  43.79 
 
 		 581 aa  483  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1899  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  44.06 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3383  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 571 aa  463  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2187  thiamine pyrophosphate protein central region  44.29 
 
 		 572 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02520  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  45.27 
 
 		 583 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  42.21 
 
 		 576 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  41.43 
 
 		 576 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  41.13 
 
 		 563 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7374  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  40.1 
 
 		 576 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.693349 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.66 
 
 		 584 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  36.73 
 
 		 584 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  37.26 
 
 		 599 aa  340  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  33.1 
 
 		 566 aa  330  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  32.92 
 
 		 566 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  32.56 
 
 		 566 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  32.74 
 
 		 566 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.03 
 
 		 549 aa  321  3e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  32.38 
 
 		 566 aa  319  9e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  33.56 
 
 		 588 aa  316  7e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3445  thiamine pyrophosphate protein  34.9 
 
 		 596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663093  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0808  thiamine pyrophosphate protein  34.41 
 
 		 593 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0856  thiamine pyrophosphate protein  34.64 
 
 		 593 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.701267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0860  thiamine pyrophosphate protein  34.3 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805016  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  29.26 
 
 		 579 aa  300  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  29.26 
 
 		 579 aa  300  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  36.47 
 
 		 590 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5572  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  35.19 
 
 		 600 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2495  thiamine pyrophosphate protein  34.32 
 
 		 599 aa  296  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.215575  normal  0.718329 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  30.82 
 
 		 578 aa  296  6e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>