More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3125 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  64.97 
 
 		 572 aa  761    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  64.91 
 
 		 572 aa  763    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  65.15 
 
 		 572 aa  762    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  78.92 
 
 		 573 aa  929    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  71.28 
 
 		 572 aa  840    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  66.78 
 
 		 575 aa  793    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  64.74 
 
 		 572 aa  763    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  64.97 
 
 		 572 aa  761    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  64.91 
 
 		 572 aa  764    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1650  pyruvate dehydrogenase  76.53 
 
 		 572 aa  852    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  71.45 
 
 		 601 aa  836    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  64.91 
 
 		 572 aa  763    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4864  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  60.35 
 
 		 575 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.662059  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0699  pyruvate dehydrogenase  76.88 
 
 		 572 aa  856    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  67.54 
 
 		 573 aa  785    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2858  pyruvate dehydrogenase  79.27 
 
 		 573 aa  926    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1935  pyruvate dehydrogenase  76.53 
 
 		 572 aa  852    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.935279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  65.15 
 
 		 572 aa  762    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  58.96 
 
 		 577 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  65.61 
 
 		 572 aa  771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  78.75 
 
 		 573 aa  926    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  64.91 
 
 		 572 aa  763    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  67.54 
 
 		 573 aa  786    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  57.37 
 
 		 574 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  59.89 
 
 		 576 aa  701    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  60.7 
 
 		 576 aa  712    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0611  pyruvate dehydrogenase  76.53 
 
 		 576 aa  852    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.69435  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2302  pyruvate dehydrogenase  76.53 
 
 		 572 aa  850    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2374  pyruvate dehydrogenase  76.31 
 
 		 573 aa  907    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  57.17 
 
 		 578 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  65.44 
 
 		 572 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  67.37 
 
 		 573 aa  784    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  60.07 
 
 		 577 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4792  pyruvate dehydrogenase  79.27 
 
 		 573 aa  927    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  65.44 
 
 		 572 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  65.09 
 
 		 572 aa  761    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  79.09 
 
 		 573 aa  930    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  100 
 
 		 574 aa  1179    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  65.44 
 
 		 572 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  67.54 
 
 		 573 aa  786    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  56.49 
 
 		 578 aa  653    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3376  pyruvate dehydrogenase  79.27 
 
 		 573 aa  927    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  59.3 
 
 		 577 aa  677    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  54.29 
 
 		 571 aa  637    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  58.96 
 
 		 577 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  79.09 
 
 		 573 aa  928    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  65.44 
 
 		 572 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2219  pyruvate dehydrogenase  76.88 
 
 		 572 aa  856    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.372281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3833  pyruvate dehydrogenase  63.99 
 
 		 583 aa  704    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1728  pyruvate dehydrogenase  76.36 
 
 		 576 aa  850    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  75.09 
 
 		 573 aa  890    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  60.25 
 
 		 576 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  51.74 
 
 		 579 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  53.22 
 
 		 578 aa  579  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  48.79 
 
 		 591 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3808  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  49.56 
 
 		 582 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  49.57 
 
 		 582 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  49.05 
 
 		 582 aa  531  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0367  pyruvate dehydrogenase  49.65 
 
 		 579 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  45.44 
 
 		 572 aa  525  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  48.85 
 
 		 588 aa  520  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  46.6 
 
 		 572 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0972  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.86 
 
 		 581 aa  511  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9103  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  49.39 
 
 		 577 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  43.73 
 
 		 579 aa  510  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.66 
 
 		 578 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  42.83 
 
 		 578 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6071  pyruvate dehydrogenase  46.25 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.96 
 
 		 578 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.2 
 
 		 576 aa  498  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3196  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  47.26 
 
 		 589 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000534651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1010  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  42.18 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2187  thiamine pyrophosphate protein central region  45.98 
 
 		 572 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02520  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  47.27 
 
 		 583 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1899  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  42.19 
 
 		 570 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3383  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.06 
 
 		 571 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  42.66 
 
 		 576 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  42.53 
 
 		 576 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  41.52 
 
 		 563 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7374  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  42.58 
 
 		 576 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.693349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  37.63 
 
 		 599 aa  356  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.65 
 
 		 584 aa  352  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  34.64 
 
 		 566 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.22 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  33.99 
 
 		 566 aa  340  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  36.08 
 
 		 584 aa  340  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  34.1 
 
 		 566 aa  339  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  33.99 
 
 		 566 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  33.87 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  32.28 
 
 		 579 aa  331  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  32.28 
 
 		 579 aa  331  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  34.6 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  31.47 
 
 		 579 aa  313  6.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4857  thiamine pyrophosphate protein  35.97 
 
 		 603 aa  313  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  36.01 
 
 		 601 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0808  thiamine pyrophosphate protein  36.61 
 
 		 593 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0856  thiamine pyrophosphate protein  36.35 
 
 		 593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.701267  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6385  thiamine pyrophosphate protein  35.87 
 
 		 610 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2355  thiamine pyrophosphate protein  36.79 
 
 		 598 aa  306  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320889  hitchhiker  0.000848806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0860  thiamine pyrophosphate protein  35.9 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>