More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2115 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  100 
 
 		 579 aa  1192    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  84.46 
 
 		 579 aa  1043    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  84.46 
 
 		 579 aa  1043    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  45.38 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  45.5 
 
 		 566 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  45.15 
 
 		 566 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  45.15 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  44.52 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  45.15 
 
 		 566 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.46 
 
 		 599 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.89 
 
 		 549 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  35.07 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  34.64 
 
 		 584 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0936  pyruvate oxidase  34.49 
 
 		 586 aa  356  6.999999999999999e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4042  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 605 aa  346  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1893  pyruvate oxidase or other thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  33.4 
 
 		 602 aa  344  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.68622e-18 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5572  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.24 
 
 		 600 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  33.39 
 
 		 576 aa  333  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  31.98 
 
 		 576 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  32.01 
 
 		 563 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3445  thiamine pyrophosphate protein  30.26 
 
 		 596 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663093  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  32.8 
 
 		 601 aa  325  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.21 
 
 		 574 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  31.91 
 
 		 576 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  33.87 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  33.87 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  33.69 
 
 		 573 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.1 
 
 		 577 aa  316  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  32.55 
 
 		 572 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  32.08 
 
 		 573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.91 
 
 		 576 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  32.55 
 
 		 572 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  32.55 
 
 		 572 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  32.55 
 
 		 572 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  33.09 
 
 		 572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  32.37 
 
 		 572 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  32.67 
 
 		 572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  32.67 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  32.67 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  30.29 
 
 		 588 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.49 
 
 		 572 aa  313  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  32.49 
 
 		 572 aa  313  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 529 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  32.31 
 
 		 572 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0860  thiamine pyrophosphate protein  31.63 
 
 		 593 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805016  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  32.31 
 
 		 572 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  30.02 
 
 		 577 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  30.02 
 
 		 577 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  32.31 
 
 		 572 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2732  thiamine pyrophosphate protein  31.61 
 
 		 596 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.53 
 
 		 591 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0856  thiamine pyrophosphate protein  31.08 
 
 		 593 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.701267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3203  thiamine pyrophosphate protein  32.62 
 
 		 590 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33590  thiamine pyrophosphate protein  31.08 
 
 		 596 aa  309  8e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  32.31 
 
 		 572 aa  309  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4857  thiamine pyrophosphate protein  30.73 
 
 		 603 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0808  thiamine pyrophosphate protein  31.08 
 
 		 593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0287  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.48 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  32.5 
 
 		 590 aa  308  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0977  pyruvate oxidase  33.08 
 
 		 606 aa  307  3e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.84134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  31.72 
 
 		 576 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  31.47 
 
 		 574 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4190  thiamine pyrophosphate protein  31.09 
 
 		 615 aa  306  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2796  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  31.09 
 
 		 597 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0268922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0017  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.69 
 
 		 599 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.28 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2089  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 597 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  32.3 
 
 		 578 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.1 
 
 		 578 aa  304  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  30.09 
 
 		 601 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  30.72 
 
 		 577 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  31.58 
 
 		 582 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2966  thiamine pyrophosphate protein  31.77 
 
 		 595 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1982  thiamine pyrophosphate protein  31.46 
 
 		 596 aa  302  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0200304  normal  0.0807898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2979  thiamine pyrophosphate protein  31.24 
 
 		 595 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0396438 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1595  pyruvate oxidase  30.57 
 
 		 603 aa  301  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  32.1 
 
 		 573 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  32.04 
 
 		 573 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4175  thiamine pyrophosphate protein  29.46 
 
 		 593 aa  299  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  30.18 
 
 		 572 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.96 
 
 		 576 aa  299  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  31.92 
 
 		 573 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.49 
 
 		 579 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  31.16 
 
 		 582 aa  299  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  29.54 
 
 		 571 aa  298  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3966  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.3 
 
 		 597 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2355  thiamine pyrophosphate protein  30.14 
 
 		 598 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320889  hitchhiker  0.000848806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2858  pyruvate dehydrogenase  31.68 
 
 		 573 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  28.57 
 
 		 572 aa  296  9e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08480  thiamine pyrophosphate protein  30.87 
 
 		 598 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00807055  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4792  pyruvate dehydrogenase  31.57 
 
 		 573 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3376  pyruvate dehydrogenase  31.57 
 
 		 573 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6385  thiamine pyrophosphate protein  31.55 
 
 		 610 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0414  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.62 
 
 		 597 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2436  thiamine pyrophosphate protein  30.62 
 
 		 595 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262777  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6220  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 596 aa  293  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863586  normal  0.0472829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  29.57 
 
 		 575 aa  293  7e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  31.33 
 
 		 573 aa  293  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.73 
 
 		 596 aa  293  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.686266 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1284  thiamine pyrophosphate protein  30.95 
 
 		 635 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283585  normal  0.383394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>