More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2345 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  77.27 
 
 
551 aa  841    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  71.25 
 
 
553 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1122    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  76.35 
 
 
555 aa  837    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  57.09 
 
 
519 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  58.96 
 
 
519 aa  547  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  54.73 
 
 
531 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  53.18 
 
 
516 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  53.68 
 
 
514 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  54.77 
 
 
519 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  53.88 
 
 
515 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  52.15 
 
 
537 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  52.42 
 
 
518 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  51.94 
 
 
518 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  51.76 
 
 
515 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  48.08 
 
 
514 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  50.58 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  50.49 
 
 
514 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  48.82 
 
 
514 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  48.64 
 
 
516 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  51.17 
 
 
515 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  49.71 
 
 
515 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  48.35 
 
 
515 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  47.96 
 
 
531 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  49.03 
 
 
512 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  48.64 
 
 
512 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  49.13 
 
 
513 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  47.28 
 
 
513 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  48.35 
 
 
514 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  47.95 
 
 
514 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  48.46 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  45.45 
 
 
527 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  47.01 
 
 
513 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  44.89 
 
 
529 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  44.7 
 
 
529 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  47 
 
 
513 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  47.36 
 
 
508 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  44.49 
 
 
526 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  34.74 
 
 
506 aa  210  6e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.7 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  38.29 
 
 
652 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.35 
 
 
562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.35 
 
 
562 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  27.51 
 
 
540 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.37 
 
 
542 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.98 
 
 
499 aa  143  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  27.85 
 
 
539 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  28 
 
 
545 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  27.12 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  27.89 
 
 
539 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  27.89 
 
 
539 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  27.89 
 
 
539 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  27.82 
 
 
540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  25.56 
 
 
536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  27.7 
 
 
539 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  27.7 
 
 
539 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  27.7 
 
 
539 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  27.7 
 
 
539 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  26.68 
 
 
529 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  24.95 
 
 
542 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  26.15 
 
 
552 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  25.79 
 
 
535 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  26.92 
 
 
527 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  25.79 
 
 
535 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  25.81 
 
 
537 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  25.51 
 
 
535 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  23.4 
 
 
540 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  25.79 
 
 
518 aa  123  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  29.32 
 
 
528 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.02 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  25.51 
 
 
535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  25.81 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  25.36 
 
 
551 aa  120  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  24.53 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 
528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.5 
 
 
576 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  24.73 
 
 
547 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  36.78 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.2 
 
 
574 aa  115  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 
529 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  34.1 
 
 
589 aa  112  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.88 
 
 
618 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  27.57 
 
 
528 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  26.87 
 
 
549 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  26.74 
 
 
548 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  25.42 
 
 
533 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  23.55 
 
 
556 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.14 
 
 
560 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.28 
 
 
604 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.22 
 
 
562 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.58 
 
 
596 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  25.91 
 
 
618 aa  104  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.56 
 
 
563 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  25.31 
 
 
567 aa  103  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.07 
 
 
552 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25.82 
 
 
548 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.76 
 
 
540 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  26.03 
 
 
570 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.75 
 
 
536 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  25.49 
 
 
547 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>