More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2713 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  90.68 
 
 		 515 aa  877    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1011    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  76.07 
 
 		 537 aa  739    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  58.72 
 
 		 515 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  55.92 
 
 		 514 aa  528  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  57.98 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  55.73 
 
 		 513 aa  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  58.64 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  56.7 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  57.2 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  55.34 
 
 		 531 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  58.37 
 
 		 514 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  56.7 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  57.98 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  52.15 
 
 		 552 aa  487  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  55.08 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  54.93 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  51.65 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  52.15 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  52.24 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  51.37 
 
 		 553 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  53 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  53.22 
 
 		 519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  50.58 
 
 		 529 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  52.44 
 
 		 551 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  51.85 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  51.34 
 
 		 529 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  53.41 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  52.42 
 
 		 555 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  52.29 
 
 		 531 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  51.27 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  49.52 
 
 		 527 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  51.46 
 
 		 515 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  52.25 
 
 		 517 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  49.81 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  52.92 
 
 		 519 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  49.51 
 
 		 513 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  50.1 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.3 
 
 		 568 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  34.62 
 
 		 506 aa  190  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  38.42 
 
 		 652 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  31.63 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  30.2 
 
 		 528 aa  143  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  31.63 
 
 		 549 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  28.41 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  30.74 
 
 		 525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.31 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  29.2 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  29.01 
 
 		 535 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  27.58 
 
 		 536 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  28.82 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  29.31 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.33 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  28.44 
 
 		 540 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  29.34 
 
 		 540 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  29.15 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  28.65 
 
 		 539 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  28.65 
 
 		 539 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  28.65 
 
 		 539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  28.46 
 
 		 539 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  28.46 
 
 		 539 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  28.46 
 
 		 539 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  28.46 
 
 		 539 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  27.58 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  27.52 
 
 		 553 aa  115  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.3 
 
 		 561 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  39.26 
 
 		 589 aa  113  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.32 
 
 		 565 aa  113  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.56 
 
 		 566 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.05 
 
 		 536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  24.68 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  27.85 
 
 		 567 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  36.26 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  22.88 
 
 		 545 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.76 
 
 		 533 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  40 
 
 		 542 aa  104  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  25.72 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  25.27 
 
 		 547 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  23.76 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  23.76 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  24.01 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  23.54 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  23.76 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.32 
 
 		 566 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  24.77 
 
 		 546 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  24.5 
 
 		 546 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  33.71 
 
 		 554 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  23.18 
 
 		 550 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  24.36 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  24.18 
 
 		 548 aa  99  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.57 
 
 		 593 aa  98.6  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  28.6 
 
 		 558 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  23.68 
 
 		 550 aa  97.4  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  23.7 
 
 		 547 aa  97.1  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  27.52 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  24.28 
 
 		 545 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1938  thiamine pyrophosphate protein central region  27.93 
 
 		 547 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.684685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  33.66 
 
 		 529 aa  93.6  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  23.06 
 
 		 546 aa  93.6  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>