More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13543 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  100 
 
 
515 aa  1010    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  70.59 
 
 
531 aa  686    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  73.03 
 
 
519 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  65.26 
 
 
519 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  63.97 
 
 
519 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  62.98 
 
 
516 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  57.52 
 
 
551 aa  544  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  57.28 
 
 
555 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  54.93 
 
 
552 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  54.02 
 
 
553 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  54.04 
 
 
518 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  52.7 
 
 
514 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  51.15 
 
 
518 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  51.84 
 
 
537 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  53.1 
 
 
515 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  52.69 
 
 
515 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  51.56 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  51.06 
 
 
518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  51.35 
 
 
514 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  51.95 
 
 
514 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  49.42 
 
 
514 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  52.23 
 
 
515 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  49.32 
 
 
513 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  50.78 
 
 
531 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  51.82 
 
 
516 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  51.26 
 
 
514 aa  428  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  50.38 
 
 
512 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  49.42 
 
 
515 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  50.1 
 
 
512 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  49.32 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  49.13 
 
 
513 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  48.34 
 
 
508 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  48.26 
 
 
513 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  47.96 
 
 
517 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  46.63 
 
 
529 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  46.82 
 
 
527 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  46.36 
 
 
529 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  47.07 
 
 
526 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  34.89 
 
 
506 aa  184  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  38.33 
 
 
652 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  29.27 
 
 
529 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  32.21 
 
 
528 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.23 
 
 
542 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  31.84 
 
 
549 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  29.48 
 
 
545 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.14 
 
 
551 aa  134  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  30.59 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  29.93 
 
 
527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  28.15 
 
 
525 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  27.5 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  28.28 
 
 
536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.32 
 
 
499 aa  128  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  29.37 
 
 
539 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  27.81 
 
 
529 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  28.41 
 
 
518 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  28.21 
 
 
535 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.37 
 
 
540 aa  123  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  28.21 
 
 
535 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.68 
 
 
536 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  26.08 
 
 
552 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  29.75 
 
 
540 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.86 
 
 
561 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.57 
 
 
568 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  23.52 
 
 
552 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  37.14 
 
 
554 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  28.68 
 
 
539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.34 
 
 
565 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  25.81 
 
 
552 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  26.16 
 
 
567 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  24.78 
 
 
549 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  27.59 
 
 
572 aa  107  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  26.76 
 
 
567 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.25 
 
 
562 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  30.43 
 
 
589 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.64 
 
 
581 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.82 
 
 
566 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.73 
 
 
565 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.64 
 
 
566 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1108  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  26.13 
 
 
583 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.46 
 
 
581 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  37.08 
 
 
543 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.91 
 
 
533 aa  101  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.26 
 
 
562 aa  101  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  25.91 
 
 
562 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  36.1 
 
 
528 aa  100  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25.77 
 
 
583 aa  100  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  26.57 
 
 
541 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.9 
 
 
563 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  32.39 
 
 
540 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.51 
 
 
562 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  34.73 
 
 
540 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1779  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.78 
 
 
585 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502039  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.51 
 
 
562 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  27.77 
 
 
563 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.53 
 
 
562 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  25.31 
 
 
562 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.87 
 
 
588 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  22.85 
 
 
554 aa  96.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0140  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.7 
 
 
565 aa  96.7  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  25.97 
 
 
574 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>