More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5213 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  72.78 
 
 
515 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  81.29 
 
 
531 aa  806    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1013    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  65.07 
 
 
519 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  60.96 
 
 
519 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  62.55 
 
 
516 aa  558  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  54.77 
 
 
552 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  56.9 
 
 
551 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  56.87 
 
 
555 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  55.3 
 
 
553 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  55.02 
 
 
514 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  52 
 
 
518 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  53.31 
 
 
537 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  51.74 
 
 
518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  52.7 
 
 
513 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  53.29 
 
 
515 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  49.81 
 
 
518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  51.54 
 
 
514 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  51.07 
 
 
514 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  51.35 
 
 
515 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  53.31 
 
 
515 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  50.94 
 
 
514 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  50.19 
 
 
514 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  50.78 
 
 
516 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  51.06 
 
 
512 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  49.81 
 
 
512 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  50.19 
 
 
515 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  49.23 
 
 
513 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  49.71 
 
 
531 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  50.49 
 
 
514 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  48.1 
 
 
517 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  48.36 
 
 
513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  47.49 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  48.36 
 
 
513 aa  398  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  47.41 
 
 
529 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  46.24 
 
 
529 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  48.93 
 
 
508 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  47.67 
 
 
526 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  37.62 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  38.17 
 
 
652 aa  159  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  30.43 
 
 
529 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  31.37 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.72 
 
 
545 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  28.49 
 
 
540 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  29.29 
 
 
549 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  30.51 
 
 
528 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  29.54 
 
 
540 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  30.93 
 
 
528 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  28.42 
 
 
542 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  28.81 
 
 
540 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.97 
 
 
499 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.22 
 
 
551 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.7 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  30.43 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  28.36 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.92 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  30.43 
 
 
535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  29.15 
 
 
540 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  28.89 
 
 
525 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  29.3 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  29.51 
 
 
539 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  29.51 
 
 
539 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  29.51 
 
 
539 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  29.51 
 
 
539 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  29.62 
 
 
535 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  29.42 
 
 
539 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  29.33 
 
 
539 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  29.33 
 
 
539 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  28.55 
 
 
537 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  28.96 
 
 
536 aa  124  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  28.92 
 
 
529 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  27.73 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  28.16 
 
 
529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  35.04 
 
 
589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  28.15 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.85 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  36.42 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.64 
 
 
568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.27 
 
 
576 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.93 
 
 
581 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.38 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.93 
 
 
581 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.53 
 
 
561 aa  110  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  24.09 
 
 
569 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.77 
 
 
569 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  26.67 
 
 
564 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  28.04 
 
 
542 aa  107  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  26.21 
 
 
562 aa  106  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.6 
 
 
563 aa  106  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  25.79 
 
 
552 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.98 
 
 
572 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.98 
 
 
572 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  25.41 
 
 
554 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1631  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.08 
 
 
559 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3076  acetolactate synthase catalytic subunit  28.6 
 
 
555 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  25.36 
 
 
554 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  23.16 
 
 
548 aa  103  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.77 
 
 
658 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  25.36 
 
 
562 aa  103  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  25.9 
 
 
562 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>