More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1545 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  70.4 
 
 
515 aa  664    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  81.29 
 
 
519 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1039    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  62.57 
 
 
519 aa  585  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  59.36 
 
 
519 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  54.73 
 
 
552 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  58.82 
 
 
516 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  55.45 
 
 
553 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  55.2 
 
 
551 aa  521  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  55.91 
 
 
555 aa  521  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  53.89 
 
 
514 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  51.7 
 
 
518 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  51.15 
 
 
537 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  50.09 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  51.23 
 
 
513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  51.34 
 
 
515 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  50.75 
 
 
514 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  48.2 
 
 
518 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  50 
 
 
514 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  52.29 
 
 
515 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  50 
 
 
514 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  50.09 
 
 
515 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  50.19 
 
 
516 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  48.96 
 
 
514 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  50 
 
 
512 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  50.57 
 
 
531 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  50.19 
 
 
514 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  49.34 
 
 
515 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  49.53 
 
 
513 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  48.69 
 
 
512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  48.02 
 
 
517 aa  401  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  48.1 
 
 
513 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  45.73 
 
 
529 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  48.3 
 
 
529 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  47.35 
 
 
527 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  48.66 
 
 
508 aa  379  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  46.11 
 
 
513 aa  379  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  47.63 
 
 
526 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  37.2 
 
 
506 aa  193  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.69 
 
 
568 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  38.66 
 
 
652 aa  160  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.21 
 
 
562 aa  158  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  27.77 
 
 
554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.09 
 
 
562 aa  153  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.91 
 
 
562 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  30.22 
 
 
529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.03 
 
 
545 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.16 
 
 
542 aa  143  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  30.56 
 
 
528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.63 
 
 
499 aa  136  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.09 
 
 
551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  28.84 
 
 
535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  28.84 
 
 
535 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  29.21 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.12 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  27.67 
 
 
525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  29.01 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  27.31 
 
 
535 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  28.83 
 
 
539 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  28.31 
 
 
535 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  28.49 
 
 
537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  28.01 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  29.26 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.01 
 
 
559 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  28.2 
 
 
540 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  28.57 
 
 
536 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.84 
 
 
561 aa  124  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  28.7 
 
 
529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.84 
 
 
536 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  27.81 
 
 
539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  27.81 
 
 
539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  29.12 
 
 
540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  27.81 
 
 
539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  27.81 
 
 
539 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  27.81 
 
 
539 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  27.81 
 
 
539 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  27.81 
 
 
539 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  26.33 
 
 
518 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  26.69 
 
 
572 aa  110  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.68 
 
 
533 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  32.64 
 
 
589 aa  106  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.55 
 
 
570 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.85 
 
 
562 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.04 
 
 
563 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.77 
 
 
576 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  26.65 
 
 
552 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.1 
 
 
581 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  37.21 
 
 
527 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  27.29 
 
 
605 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.38 
 
 
565 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  25.09 
 
 
547 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.92 
 
 
581 aa  99.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  26 
 
 
623 aa  98.6  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  36.78 
 
 
540 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3076  acetolactate synthase catalytic subunit  26.85 
 
 
555 aa  97.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  36.84 
 
 
542 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  25.09 
 
 
567 aa  97.4  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  24.73 
 
 
552 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  26.1 
 
 
561 aa  95.1  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  23.37 
 
 
554 aa  94.7  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>