More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0428 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  100 
 
 
583 aa  1204    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  49.57 
 
 
583 aa  597  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  52.56 
 
 
547 aa  596  1e-169  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  49.91 
 
 
545 aa  579  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  50.83 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  50.46 
 
 
547 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  50.83 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  49.72 
 
 
550 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  49.54 
 
 
547 aa  567  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  49.64 
 
 
547 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  49.46 
 
 
545 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  48.54 
 
 
547 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  45.05 
 
 
554 aa  489  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  42.19 
 
 
544 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  41.04 
 
 
547 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  40.22 
 
 
547 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  40.22 
 
 
547 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  41.18 
 
 
544 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  40.41 
 
 
547 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  40.04 
 
 
547 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  40.04 
 
 
547 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  40.22 
 
 
547 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  40.04 
 
 
547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  40.41 
 
 
547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  40.04 
 
 
547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  39.85 
 
 
547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  38.94 
 
 
550 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  39.48 
 
 
556 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  40.3 
 
 
547 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  40.37 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  38.94 
 
 
550 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  38.24 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  39.74 
 
 
546 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  38.24 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  38.24 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  38.24 
 
 
546 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  40.07 
 
 
563 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  40.93 
 
 
552 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  39.85 
 
 
550 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  41.33 
 
 
526 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  38.24 
 
 
546 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  38.24 
 
 
546 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  37.87 
 
 
546 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  38.5 
 
 
550 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  41.28 
 
 
546 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  39.56 
 
 
552 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.63 
 
 
554 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  40.04 
 
 
558 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.77 
 
 
550 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  39.41 
 
 
548 aa  385  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  39.38 
 
 
548 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  38.25 
 
 
551 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  36.76 
 
 
546 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  36.58 
 
 
546 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  36.76 
 
 
546 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  36.76 
 
 
546 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  36.76 
 
 
546 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  36.58 
 
 
546 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  36.76 
 
 
546 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  36.58 
 
 
546 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  37.71 
 
 
565 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.91 
 
 
546 aa  330  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  34.73 
 
 
558 aa  327  3e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  35.74 
 
 
553 aa  324  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  34.07 
 
 
562 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  34.07 
 
 
565 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  34.07 
 
 
562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  34.07 
 
 
565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  34.25 
 
 
562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  34.44 
 
 
565 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  34.29 
 
 
560 aa  319  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  34.25 
 
 
562 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  34.25 
 
 
562 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  34.25 
 
 
562 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  36.75 
 
 
587 aa  318  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  35.48 
 
 
559 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  34.85 
 
 
567 aa  317  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  35.03 
 
 
567 aa  317  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  34.2 
 
 
559 aa  317  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  34.07 
 
 
562 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  34.98 
 
 
559 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  36.53 
 
 
587 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  34.5 
 
 
559 aa  312  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  35.3 
 
 
587 aa  312  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  35.64 
 
 
599 aa  311  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  36.35 
 
 
587 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.35 
 
 
552 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.06 
 
 
569 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  32.55 
 
 
548 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.04 
 
 
553 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.56 
 
 
557 aa  306  6e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  35.77 
 
 
559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.31 
 
 
588 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3432  acetolactate synthase  35.58 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  33.46 
 
 
554 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  34 
 
 
542 aa  303  8.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.88 
 
 
554 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.02 
 
 
557 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.66 
 
 
556 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.46 
 
 
562 aa  300  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>