143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3710 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4227  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  50.55 
 
 		 821 aa  861    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3710  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  100 
 
 		 823 aa  1699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6305  Type IV secretory pathway VirB4-like protein  29.27 
 
 		 818 aa  336  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  28.81 
 
 		 815 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  26.48 
 
 		 846 aa  282  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.77 
 
 		 825 aa  278  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.02 
 
 		 825 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.74 
 
 		 827 aa  269  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.51 
 
 		 844 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5013  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.4 
 
 		 892 aa  239  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5418  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.28 
 
 		 892 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4260  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.41 
 
 		 831 aa  210  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.21 
 
 		 850 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  24.9 
 
 		 810 aa  171  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  25.26 
 
 		 816 aa  161  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  25.32 
 
 		 813 aa  160  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  25.13 
 
 		 817 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  27.65 
 
 		 824 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  25.73 
 
 		 819 aa  157  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  29.53 
 
 		 822 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  28.33 
 
 		 812 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  25.42 
 
 		 817 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  26.38 
 
 		 820 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  27.29 
 
 		 819 aa  151  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  26.82 
 
 		 819 aa  151  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  30.61 
 
 		 687 aa  150  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  24.76 
 
 		 823 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  26.79 
 
 		 816 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  26.49 
 
 		 811 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  27.48 
 
 		 817 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  27.68 
 
 		 817 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  26.88 
 
 		 809 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  27.49 
 
 		 816 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  24.63 
 
 		 823 aa  148  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  25.06 
 
 		 812 aa  147  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  26.72 
 
 		 817 aa  147  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  27.62 
 
 		 808 aa  147  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  25.34 
 
 		 815 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  27.85 
 
 		 830 aa  146  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  23.83 
 
 		 817 aa  146  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  25.16 
 
 		 820 aa  145  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  28.16 
 
 		 813 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  24.59 
 
 		 825 aa  145  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  27.48 
 
 		 816 aa  144  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  29.21 
 
 		 836 aa  144  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  23.51 
 
 		 819 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  26.58 
 
 		 816 aa  143  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  25.31 
 
 		 812 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  25.53 
 
 		 813 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  28.88 
 
 		 872 aa  141  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  29.52 
 
 		 814 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  28.04 
 
 		 816 aa  140  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  28.04 
 
 		 816 aa  140  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  28.15 
 
 		 836 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  25.59 
 
 		 819 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  28.32 
 
 		 847 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  27.87 
 
 		 821 aa  138  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  29.5 
 
 		 877 aa  135  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  28.76 
 
 		 813 aa  134  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  27.65 
 
 		 822 aa  134  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  24.12 
 
 		 813 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  27.42 
 
 		 812 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  27.56 
 
 		 808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  27.48 
 
 		 811 aa  132  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  23.87 
 
 		 820 aa  132  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  27.19 
 
 		 812 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  25.97 
 
 		 809 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  27.58 
 
 		 845 aa  130  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  28.31 
 
 		 814 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  28.07 
 
 		 812 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  28.1 
 
 		 813 aa  128  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.61 
 
 		 790 aa  128  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  27.91 
 
 		 814 aa  127  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  27.19 
 
 		 818 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  28.2 
 
 		 816 aa  125  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  27.46 
 
 		 809 aa  124  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.43 
 
 		 843 aa  124  9e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  29.04 
 
 		 840 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  28.05 
 
 		 829 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  27.07 
 
 		 812 aa  122  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  26.91 
 
 		 812 aa  121  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.44 
 
 		 793 aa  120  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  25 
 
 		 788 aa  120  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.94 
 
 		 840 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  27.64 
 
 		 812 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.94 
 
 		 840 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.03 
 
 		 785 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.83 
 
 		 796 aa  117  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  23.61 
 
 		 803 aa  116  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  25.1 
 
 		 854 aa  114  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.39 
 
 		 850 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  24.56 
 
 		 801 aa  110  7.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  21.44 
 
 		 800 aa  109  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  20.95 
 
 		 800 aa  108  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  27.04 
 
 		 852 aa  107  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  27.04 
 
 		 852 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.93 
 
 		 804 aa  106  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  26.79 
 
 		 852 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.01 
 
 		 805 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  25.33 
 
 		 797 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>