More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05966 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  78.1 
 
 		 242 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 239 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  33.66 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.91 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.91 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  23.02 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 372 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  55.26 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  37.14 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 189 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  35.8 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  26.56 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 199 aa  52.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 346 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 198 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  36.71 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.62 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  23.18 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  39.34 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 354 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 352 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  27.6 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>