More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000668 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 		 1063 aa  852    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.01 
 
 		 1074 aa  958    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  67.18 
 
 		 1056 aa  1430    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.48 
 
 		 1067 aa  841    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 		 1063 aa  852    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  46.45 
 
 		 1073 aa  953    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  42.31 
 
 		 1063 aa  852    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  42.31 
 
 		 1063 aa  851    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  92.2 
 
 		 1052 aa  1952    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.36 
 
 		 1093 aa  888    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  46.61 
 
 		 1060 aa  954    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  41.63 
 
 		 1053 aa  825    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  68.5 
 
 		 1069 aa  1457    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  100 
 
 		 1050 aa  2138    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  43.38 
 
 		 1048 aa  848    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  46.88 
 
 		 1060 aa  961    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  43.27 
 
 		 1067 aa  858    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  43.29 
 
 		 1067 aa  863    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 		 1050 aa  819    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  47.36 
 
 		 1057 aa  959    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  46.22 
 
 		 1061 aa  927    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  41.54 
 
 		 1055 aa  815    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  42.55 
 
 		 1063 aa  844    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  46.87 
 
 		 1060 aa  920    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  42.71 
 
 		 1067 aa  855    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1049 aa  813    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.71 
 
 		 1067 aa  809    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  42.39 
 
 		 1044 aa  828    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  36.54 
 
 		 1039 aa  627  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.02 
 
 		 1041 aa  623  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1121 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  33.94 
 
 		 1052 aa  592  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  35.05 
 
 		 1072 aa  585  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1032 aa  568  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  34.14 
 
 		 1038 aa  566  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 		 1053 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1068 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  33.01 
 
 		 1042 aa  558  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1051 aa  542  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1062 aa  532  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1066 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1034 aa  515  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1041 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1053 aa  498  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1054 aa  496  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  31.3 
 
 		 1048 aa  495  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  31.94 
 
 		 1071 aa  493  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1054 aa  491  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.5 
 
 		 1060 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1033 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  30.71 
 
 		 1098 aa  481  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1048 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  30.35 
 
 		 1053 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 		 1035 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 		 1041 aa  475  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1041 aa  474  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1033 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.5 
 
 		 1075 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1040 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.94 
 
 		 1054 aa  468  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1036 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 		 1043 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1033 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1063 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1050 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  29.66 
 
 		 1034 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1074 aa  442  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1053 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1030 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1064 aa  422  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1035 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1131 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  28.56 
 
 		 1135 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1030 aa  335  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1035 aa  327  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1044 aa  320  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1137 aa  312  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  24.14 
 
 		 1044 aa  295  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  25.41 
 
 		 1005 aa  294  5e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.9 
 
 		 1034 aa  294  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1092 aa  293  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.56 
 
 		 1043 aa  290  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1011 aa  287  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1043 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.38 
 
 		 1046 aa  285  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1038 aa  284  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  23.63 
 
 		 1064 aa  284  8.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1017 aa  282  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1034 aa  282  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1031 aa  281  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.02 
 
 		 1070 aa  281  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  22.73 
 
 		 1057 aa  279  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1031 aa  279  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1047 aa  278  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  24.27 
 
 		 1059 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 1050 aa  278  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1031 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  24.9 
 
 		 1031 aa  277  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  23.3 
 
 		 1006 aa  277  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  23.55 
 
 		 1039 aa  277  9e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>