More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3678 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3909  ribonuclease II  58.33 
 
 		 637 aa  719    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3678  ribonuclease II  100 
 
 		 635 aa  1291    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1234  ribonuclease II  52.67 
 
 		 622 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.334774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2575  ribonuclease II  51.61 
 
 		 619 aa  633  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0536  ribonuclease II  49.52 
 
 		 617 aa  594  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2613  ribonuclease II  49.13 
 
 		 698 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3023  ribonuclease II  49.29 
 
 		 698 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2857  ribonuclease II  49.29 
 
 		 714 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3056  ribonuclease II  48.2 
 
 		 712 aa  571  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.235713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2779  hypothetical protein  48.19 
 
 		 693 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3694  ribonuclease II  47.74 
 
 		 695 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0513  ribonuclease II  47.58 
 
 		 696 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0537  ribonuclease II  47.58 
 
 		 696 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.731192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3459  ribonuclease II (RNB)-like protein  47.35 
 
 		 692 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3497  ribonuclease II (RNB)-like protein  47.35 
 
 		 692 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2773  ribonuclease II  47.11 
 
 		 690 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0538  putative ribonuclease II  47.12 
 
 		 709 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0580  ribonuclease II  46.8 
 
 		 696 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257704 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2495  ribonuclease II (RNB) family protein  47.2 
 
 		 692 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1275  ribonuclease II (RNB) family protein  47.2 
 
 		 692 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0129  ribonuclease II  46.96 
 
 		 694 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3290  ribonuclease II (RNB)-like protein  47.2 
 
 		 692 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0415  ribonuclease II (RNB) family protein  47.2 
 
 		 692 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0351971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2623  ribonuclease II  47.35 
 
 		 701 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0612  ribonuclease II  46.96 
 
 		 694 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3420  ribonuclease II  46.5 
 
 		 705 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3199  hypothetical protein  45.75 
 
 		 685 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0554772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1089  ribonuclease II  45.88 
 
 		 691 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3494  ribonuclease II (RNB) family protein  47.88 
 
 		 639 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3405  ribonuclease II  44.62 
 
 		 707 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.185041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1170  ribonuclease II  47.71 
 
 		 637 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3654  ribonuclease II  43.69 
 
 		 695 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.55944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3980  ribonuclease II  44.85 
 
 		 705 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000301096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1484  ribonuclease II  44.74 
 
 		 692 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3411  ribonuclease II  44.12 
 
 		 695 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0843  ribonuclease II  43.28 
 
 		 693 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2964  ribonuclease II  42.33 
 
 		 723 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0937  ribonuclease II  44.07 
 
 		 686 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.371224  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2195  ribonuclease II  42.19 
 
 		 702 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0215  ribonuclease II  40 
 
 		 676 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0236  ribonuclease II  40.27 
 
 		 680 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  27.49 
 
 		 698 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  27.14 
 
 		 659 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  25.83 
 
 		 671 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0179  ribonuclease II  26.07 
 
 		 698 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.35632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  27.64 
 
 		 676 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  26.5 
 
 		 670 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  24.81 
 
 		 666 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  26.54 
 
 		 674 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  26.17 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  28.57 
 
 		 686 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  26.17 
 
 		 671 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  25.56 
 
 		 671 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1943  ribonuclease II  28.24 
 
 		 735 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  24.7 
 
 		 680 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  26.1 
 
 		 680 aa  95.9  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  26.91 
 
 		 735 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  26.89 
 
 		 683 aa  90.5  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  25.45 
 
 		 676 aa  88.6  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  24.87 
 
 		 602 aa  87.8  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  27.03 
 
 		 689 aa  87.8  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  24.73 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  26.42 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4448  ribonuclease II  28.07 
 
 		 617 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  29.53 
 
 		 863 aa  80.9  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  24.95 
 
 		 646 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  23.42 
 
 		 394 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  25.37 
 
 		 623 aa  76.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  23.97 
 
 		 683 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  22.07 
 
 		 424 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1546  putative ribonuclease II  28.05 
 
 		 465 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0108155 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  24.72 
 
 		 737 aa  73.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  24.42 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  26.6 
 
 		 794 aa  72  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  23.08 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  24.14 
 
 		 937 aa  71.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1511  RNAse R  24.42 
 
 		 766 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193382 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  22.08 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  22.61 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  26.91 
 
 		 762 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  28.21 
 
 		 795 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83466  3'-5' RNA exonuclease complex component  26.14 
 
 		 1146 aa  69.3  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00000298042 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  26.75 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  26.75 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  25.66 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1518  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  24.3 
 
 		 750 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  26.13 
 
 		 706 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1545  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  24.3 
 
 		 750 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.405162  normal  0.0471328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  25.92 
 
 		 801 aa  67  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2180  exoribonuclease II  25 
 
 		 644 aa  66.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801772 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  25.2 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  26.55 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  25.88 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  21.52 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  25.11 
 
 		 815 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  25.86 
 
 		 813 aa  63.9  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  27.8 
 
 		 708 aa  63.9  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  24.36 
 
 		 678 aa  63.9  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  25.68 
 
 		 704 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  23.7 
 
 		 758 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>