More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1998 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 956 aa  1844    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  36.3 
 
 		 956 aa  330  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 1030 aa  283  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  31.47 
 
 		 919 aa  211  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  31.42 
 
 		 895 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  36.46 
 
 		 981 aa  182  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  29.64 
 
 		 959 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 1015 aa  118  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  26.55 
 
 		 928 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  30.8 
 
 		 1089 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.44 
 
 		 1029 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  34.05 
 
 		 1055 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.46 
 
 		 1022 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.52 
 
 		 900 aa  105  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 1118 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.83 
 
 		 1141 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 723 aa  102  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 998 aa  101  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  27.46 
 
 		 925 aa  101  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  29.33 
 
 		 1121 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  26.59 
 
 		 959 aa  96.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 940 aa  95.5  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.08 
 
 		 1081 aa  95.1  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.61 
 
 		 1080 aa  95.5  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.33 
 
 		 1139 aa  94.4  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.84 
 
 		 1146 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.32 
 
 		 1013 aa  94  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  30.8 
 
 		 960 aa  94  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  28.75 
 
 		 884 aa  92.8  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.18 
 
 		 1006 aa  92  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  31.57 
 
 		 932 aa  92  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 1005 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 1089 aa  89.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 1148 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  27.82 
 
 		 992 aa  88.6  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.86 
 
 		 1067 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.2 
 
 		 1055 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  29.48 
 
 		 974 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  29.54 
 
 		 947 aa  86.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 952 aa  86.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  32.22 
 
 		 936 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 877 aa  86.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 		 1063 aa  84.7  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  27.94 
 
 		 1029 aa  84.3  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25 
 
 		 1134 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 1198 aa  83.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.58 
 
 		 923 aa  83.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 937 aa  82.8  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 979 aa  82.8  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.57 
 
 		 1126 aa  82.4  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.05 
 
 		 2279 aa  81.3  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.43 
 
 		 1054 aa  81.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.25 
 
 		 1160 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  25.56 
 
 		 1922 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  41.6 
 
 		 982 aa  79.7  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 		 1050 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.57 
 
 		 1050 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.97 
 
 		 1139 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  24.93 
 
 		 967 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.85 
 
 		 1122 aa  79.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 1151 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.11 
 
 		 1148 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 881 aa  79  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 1193 aa  79  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  42.64 
 
 		 967 aa  78.2  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  41.96 
 
 		 1084 aa  77.8  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.16 
 
 		 1227 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 		 1094 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  31.18 
 
 		 957 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  29.36 
 
 		 1132 aa  77  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  22.9 
 
 		 2272 aa  77  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  26.33 
 
 		 1051 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  28.3 
 
 		 1013 aa  76.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 983 aa  76.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 919 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.57 
 
 		 2303 aa  77  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  39.78 
 
 		 552 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.77 
 
 		 1780 aa  77  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 1141 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  29.7 
 
 		 1118 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  46.81 
 
 		 913 aa  75.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  28.51 
 
 		 1133 aa  75.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  42.28 
 
 		 916 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  30.26 
 
 		 937 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.31 
 
 		 1089 aa  75.5  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.92 
 
 		 1053 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  24.8 
 
 		 1142 aa  75.5  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.83 
 
 		 1295 aa  75.5  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30 
 
 		 2109 aa  75.1  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  28.86 
 
 		 922 aa  74.7  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  23.74 
 
 		 1020 aa  74.3  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  28.54 
 
 		 1353 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 1190 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  24.72 
 
 		 862 aa  74.3  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 		 1398 aa  73.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  29.14 
 
 		 920 aa  73.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  32 
 
 		 940 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>