More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2045 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 342 aa  686    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  54.55 
 
 		 385 aa  328  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  47.59 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  50.31 
 
 		 387 aa  285  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  43.6 
 
 		 397 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  44.41 
 
 		 685 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  43.65 
 
 		 456 aa  255  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  43.91 
 
 		 536 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  51.33 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  40.4 
 
 		 456 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  36.31 
 
 		 417 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  39.87 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  39.16 
 
 		 468 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  40.31 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  36.31 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  40.39 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  40.79 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  35.76 
 
 		 407 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  38.91 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  34.53 
 
 		 587 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  33.94 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  40.95 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  33.93 
 
 		 415 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  37.06 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  35.36 
 
 		 396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  32.64 
 
 		 485 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  33.72 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  35.87 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 588 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  36.97 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  36.26 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  33.62 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  34.53 
 
 		 363 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.45 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  33.14 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  35.78 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  31.82 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  30.97 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  30.66 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.11 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.37 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  33.54 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  29.22 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  35.92 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  31.6 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  32.28 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  31.3 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  35.09 
 
 		 352 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  30.51 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  31.64 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  30.47 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  31.47 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 362 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  28.77 
 
 		 339 aa  136  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  38.69 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  28.43 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  30.22 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.55 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.22 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.53 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  33.11 
 
 		 356 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  34.46 
 
 		 344 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  33.56 
 
 		 344 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  31.6 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 		 356 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  28.97 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  32.55 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  32.55 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  29.34 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  31.37 
 
 		 362 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  29.62 
 
 		 340 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  35.29 
 
 		 326 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  31.56 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  30.07 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 371 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 		 331 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  29.34 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  33.89 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  35.14 
 
 		 623 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  35.23 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  32.32 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  29.18 
 
 		 658 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>