More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1778 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  91.96 
 
 		 200 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  34.69 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  42.19 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  24 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  38.6 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>