More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2291 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 922 aa  1858    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  42.08 
 
 		 939 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  38.91 
 
 		 920 aa  561  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 1004 aa  472  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 1000 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 987 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 951 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 966 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 957 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 946 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 947 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 951 aa  333  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 976 aa  315  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 935 aa  313  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 967 aa  308  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 969 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 944 aa  300  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 1028 aa  299  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 1040 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 1057 aa  295  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 873 aa  288  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 869 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 998 aa  279  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 901 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 873 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 976 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.68 
 
 		 961 aa  263  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 1032 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 966 aa  259  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.44 
 
 		 969 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 897 aa  253  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 981 aa  251  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.98 
 
 		 1007 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1020 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 935 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 935 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 935 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 930 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 930 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 966 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 930 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 1007 aa  240  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 933 aa  240  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 965 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 937 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 824 aa  235  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 841 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 953 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 843 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 904 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 904 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 904 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  25.46 
 
 		 936 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 914 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 952 aa  228  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 938 aa  227  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 904 aa  227  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 958 aa  225  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 958 aa  224  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 836 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 982 aa  222  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 940 aa  221  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 		 966 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 855 aa  221  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 855 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 1034 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.12 
 
 		 839 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  27.12 
 
 		 914 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 987 aa  212  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 1041 aa  210  9e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 975 aa  210  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 1041 aa  208  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 907 aa  207  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 924 aa  204  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 912 aa  204  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 944 aa  204  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 1088 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 944 aa  202  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 964 aa  201  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 981 aa  200  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 891 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  23.99 
 
 		 974 aa  195  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 985 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 935 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 907 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 927 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 817 aa  180  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.18 
 
 		 929 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  25.45 
 
 		 899 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 1055 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 1000 aa  174  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 928 aa  172  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  25.53 
 
 		 895 aa  172  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 709 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 924 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 924 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 924 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 908 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 912 aa  164  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 981 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>