136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5129 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  34.29 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 221 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 225 aa  86.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  29.37 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  28.8 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  38.14 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  25.72 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  26.24 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  23.61 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  22.54 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 197 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  22.49 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 203 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 222 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  26.42 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  26.13 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  34.83 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 470 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  35.87 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>