More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 251 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  34.81 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  32.8 
 
 		 248 aa  71.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 		 237 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  62.5 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  34.17 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  29.26 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  40.91 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  62.22 
 
 		 257 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  53.33 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  59.52 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 280 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>