More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1740 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  65.76 
 
 		 565 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  65.76 
 
 		 565 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  74.27 
 
 		 566 aa  790    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  64.52 
 
 		 563 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  64.61 
 
 		 565 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  65.76 
 
 		 565 aa  708    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  64.59 
 
 		 563 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  64.9 
 
 		 580 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  64.98 
 
 		 559 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  65.76 
 
 		 565 aa  708    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  65.36 
 
 		 578 aa  703    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  71.51 
 
 		 566 aa  746    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  66.79 
 
 		 566 aa  740    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  61.76 
 
 		 565 aa  663    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  65.54 
 
 		 557 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  66.49 
 
 		 575 aa  709    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  65.02 
 
 		 578 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  68.46 
 
 		 559 aa  743    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  65.19 
 
 		 578 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  66.73 
 
 		 563 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  64.43 
 
 		 565 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  100 
 
 		 559 aa  1099    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  65.19 
 
 		 578 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  65.26 
 
 		 578 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  60.69 
 
 		 559 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  72.44 
 
 		 442 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  57.12 
 
 		 580 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  57.3 
 
 		 588 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  61.63 
 
 		 507 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  60.83 
 
 		 248 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  33.91 
 
 		 704 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  33.91 
 
 		 704 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  58.82 
 
 		 222 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  38.08 
 
 		 770 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  33.14 
 
 		 716 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  38.99 
 
 		 411 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  41.02 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  41.02 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  41.02 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  41.02 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  36.91 
 
 		 422 aa  212  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  35.27 
 
 		 630 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  38.22 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  37.43 
 
 		 420 aa  204  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  36.39 
 
 		 394 aa  203  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  38.13 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  37.43 
 
 		 398 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  37.43 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  37.43 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  36.88 
 
 		 428 aa  198  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  32.58 
 
 		 710 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  35.84 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  32.64 
 
 		 733 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  56.55 
 
 		 185 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  31.22 
 
 		 577 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  31.16 
 
 		 577 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  34.15 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  30.8 
 
 		 609 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  32.42 
 
 		 618 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  29.62 
 
 		 609 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  30.2 
 
 		 618 aa  151  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  31.57 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  28.36 
 
 		 732 aa  143  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 624 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  31.74 
 
 		 734 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  38.24 
 
 		 616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  30.26 
 
 		 797 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  31.96 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  28.33 
 
 		 436 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  27.3 
 
 		 444 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  25.65 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  25.21 
 
 		 376 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  31.17 
 
 		 508 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  33.56 
 
 		 527 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25.27 
 
 		 415 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  29.66 
 
 		 398 aa  95.1  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 417 aa  93.2  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  28.22 
 
 		 526 aa  93.2  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  23.79 
 
 		 406 aa  93.2  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  31.06 
 
 		 295 aa  91.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  25.41 
 
 		 418 aa  90.5  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  28.03 
 
 		 527 aa  90.5  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  25.63 
 
 		 336 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  25.07 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  25.07 
 
 		 408 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 415 aa  86.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  30.12 
 
 		 308 aa  86.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  32.83 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  30.35 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  28.98 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  29.04 
 
 		 302 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  31.58 
 
 		 325 aa  83.2  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  31.42 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  35.63 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  36.69 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 298 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  26.21 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 339 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  29.92 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  31.84 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>