More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3184 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3184  ROK family protein  100 
 
 		 416 aa  838    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00402315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2924  ROK family protein  92.84 
 
 		 407 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.381987 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4468  putative transcriptional regulator protein  63.93 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1214  transcriptional regulator  55.97 
 
 		 400 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  31.62 
 
 		 442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  29.89 
 
 		 435 aa  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.57 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  26.61 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  26.34 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25 
 
 		 391 aa  99.4  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.67 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.79 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  26.25 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.72 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  30.65 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  27.01 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  28.23 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  29.29 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  27.14 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  30.6 
 
 		 397 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.55 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.49 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.26 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.72 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  28.57 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.92 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  27.07 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.3 
 
 		 410 aa  86.3  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  23.71 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  24.62 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  25.65 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  24.38 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  24.92 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  26.27 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.26 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  27.08 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  24.06 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  27.62 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  25.38 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  27.59 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  25.59 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  27.84 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  24.63 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  22.77 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  22.53 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.77 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  25.66 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  27.27 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  24.73 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  23.08 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.46 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.02 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  28.27 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  24.56 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  21.91 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  21.92 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  24.37 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  25.71 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  24.54 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  24.26 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  25.99 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.45 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.32 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  24.23 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1865  ROK family protein  25.32 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  27.8 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  27.14 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  24.64 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  21.82 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  27.27 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  25.7 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  26.88 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  25.63 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  25.38 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.97 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  27.66 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  23.12 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  26.3 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  25.71 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  23.17 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  27.46 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  25.97 
 
 		 320 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  24.85 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  23.2 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  25.92 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.33 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  26.93 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  25.87 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
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NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  21.47 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1684  ROK family protein  25.76 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805279  normal  1 
 
 
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NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.15 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  26.77 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  22.26 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  27.84 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
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NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  25.77 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  25 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  26.81 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  26.33 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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