More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2306 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  94.19 
 
 		 483 aa  849    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  100 
 
 		 483 aa  947    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  70.69 
 
 		 491 aa  631  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  69.92 
 
 		 489 aa  628  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  71.31 
 
 		 491 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  68.29 
 
 		 504 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  67.86 
 
 		 480 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  69.57 
 
 		 493 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  67.73 
 
 		 494 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  67.87 
 
 		 476 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  69.89 
 
 		 597 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  66.53 
 
 		 495 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  64.96 
 
 		 481 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  66.88 
 
 		 493 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  64.51 
 
 		 488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  64.44 
 
 		 484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  63.5 
 
 		 492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  63.71 
 
 		 492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  63.1 
 
 		 490 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  64.35 
 
 		 492 aa  558  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  64.04 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  54.34 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  56.84 
 
 		 474 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  52.07 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  56.29 
 
 		 483 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  54.9 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  55.89 
 
 		 514 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  52.82 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  50.95 
 
 		 479 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  50.64 
 
 		 493 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  51.36 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  54.39 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  50.11 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  48.34 
 
 		 495 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  54.05 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  29 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  29 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.1 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 485 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 451 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  39.47 
 
 		 485 aa  126  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 435 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  30.03 
 
 		 449 aa  124  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 479 aa  123  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 479 aa  123  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.94 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.12 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  28.22 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 473 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.31 
 
 		 462 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.21 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.11 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.46 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.85 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.38 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 436 aa  113  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  29.1 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  27.51 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.09 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.52 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  26.56 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.08 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.58 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.56 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  26.16 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>