More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0894 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  447  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  42.65 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  25.75 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  28.26 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.4 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  26.4 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  26.9 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  26.94 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  26.4 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  27.33 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.37 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.37 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.37 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.37 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  25.89 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  25.39 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.37 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  43.86 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  26.58 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  24.48 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  30.77 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>