More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0721 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  81.13 
 
 		 851 aa  793    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 1764 aa  3486    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  44.46 
 
 		 1134 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  44.09 
 
 		 2467 aa  443  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  42.78 
 
 		 2807 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.39 
 
 		 1415 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  38.3 
 
 		 1133 aa  350  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  35.99 
 
 		 3954 aa  340  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  41.46 
 
 		 2133 aa  313  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  51.98 
 
 		 2954 aa  272  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  39.64 
 
 		 2198 aa  261  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  44.39 
 
 		 768 aa  249  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  36.2 
 
 		 4334 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  36.31 
 
 		 1855 aa  228  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  42.54 
 
 		 907 aa  222  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  46.25 
 
 		 395 aa  210  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  45.95 
 
 		 395 aa  208  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  39.87 
 
 		 3209 aa  205  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.5 
 
 		 3026 aa  197  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.95 
 
 		 1029 aa  196  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  37.29 
 
 		 1610 aa  196  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  45.95 
 
 		 1029 aa  196  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  40.16 
 
 		 3608 aa  189  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33 
 
 		 2911 aa  182  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  42.46 
 
 		 3619 aa  178  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 		 1534 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.46 
 
 		 3619 aa  175  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.18 
 
 		 1145 aa  172  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  35.16 
 
 		 1532 aa  171  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  29.98 
 
 		 1582 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  37.88 
 
 		 1610 aa  163  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  30.54 
 
 		 2097 aa  163  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  45.53 
 
 		 462 aa  160  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  28.59 
 
 		 1213 aa  148  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  41.54 
 
 		 503 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.19 
 
 		 1079 aa  143  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  27.78 
 
 		 1628 aa  142  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  42.26 
 
 		 503 aa  142  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  37.57 
 
 		 820 aa  140  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  32.05 
 
 		 2950 aa  137  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  37.41 
 
 		 535 aa  136  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  42.5 
 
 		 1197 aa  135  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.26 
 
 		 1390 aa  134  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  29.06 
 
 		 824 aa  134  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.2 
 
 		 1400 aa  129  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.54 
 
 		 8871 aa  127  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.6 
 
 		 1279 aa  127  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  37.92 
 
 		 535 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 		 467 aa  123  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  28.21 
 
 		 1286 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.85 
 
 		 946 aa  122  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.74 
 
 		 1019 aa  119  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  29.26 
 
 		 833 aa  119  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  40 
 
 		 727 aa  116  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.69 
 
 		 2678 aa  115  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  35.15 
 
 		 492 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  35.45 
 
 		 475 aa  111  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4916  hemolysin-type calcium-binding region  36.67 
 
 		 452 aa  111  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  39.8 
 
 		 1557 aa  110  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  35.12 
 
 		 475 aa  109  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  40.65 
 
 		 1055 aa  108  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  30.6 
 
 		 4800 aa  103  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  50.93 
 
 		 614 aa  102  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.31 
 
 		 2701 aa  102  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  30.57 
 
 		 965 aa  102  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.14 
 
 		 3598 aa  102  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  28.82 
 
 		 745 aa  102  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  44.59 
 
 		 546 aa  101  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  27.08 
 
 		 6276 aa  100  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  50.81 
 
 		 7284 aa  99  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  28.39 
 
 		 1112 aa  98.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  27.32 
 
 		 1156 aa  98.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 574 aa  98.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  33.42 
 
 		 2775 aa  98.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  41.67 
 
 		 621 aa  97.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  37.97 
 
 		 448 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  29.36 
 
 		 2836 aa  95.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  29.09 
 
 		 1112 aa  95.5  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  26.5 
 
 		 1499 aa  95.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  29.32 
 
 		 556 aa  94  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  31.36 
 
 		 759 aa  93.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  44.94 
 
 		 531 aa  93.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.02 
 
 		 588 aa  93.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.14 
 
 		 1363 aa  94  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.14 
 
 		 2245 aa  93.2  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  44.3 
 
 		 531 aa  92.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  30.75 
 
 		 1884 aa  92.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  33.52 
 
 		 648 aa  90.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  25.97 
 
 		 1480 aa  89.4  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  26.75 
 
 		 2689 aa  89  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  43.26 
 
 		 608 aa  89  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  31.46 
 
 		 2105 aa  88.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  47.59 
 
 		 540 aa  87.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  32.76 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  39.75 
 
 		 1650 aa  85.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.61 
 
 		 1180 aa  85.9  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  27.49 
 
 		 998 aa  85.5  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  31.35 
 
 		 1072 aa  84.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  25.72 
 
 		 764 aa  85.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  46.9 
 
 		 540 aa  84.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>