More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2336 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2653  DNA ligase (NAD(+))  64.9 
 
 		 648 aa  875    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.869287  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2336  DNA ligase (NAD(+))  100 
 
 		 649 aa  1336    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182524  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2078  DNA ligase (NAD(+))  42.31 
 
 		 615 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2695  DNA ligase (NAD(+))  40.3 
 
 		 652 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.278401  normal  0.204857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1230  DNA ligase, NAD-dependent, putative  37.25 
 
 		 609 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2541  NAD-dependent DNA ligase LigA  29.56 
 
 		 662 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00953923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2245  NAD-dependent DNA ligase LigA  29.14 
 
 		 662 aa  234  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1227  DNA ligase, NAD-dependent  29.49 
 
 		 656 aa  223  7e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  28.35 
 
 		 694 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  29.32 
 
 		 673 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1371  DNA ligase, NAD-dependent  28.4 
 
 		 648 aa  221  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00123694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  29.64 
 
 		 673 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2645  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.72 
 
 		 710 aa  213  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  26.77 
 
 		 712 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  27.52 
 
 		 668 aa  209  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  28.29 
 
 		 667 aa  209  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0483  DNA ligase, NAD-dependent  28.7 
 
 		 674 aa  209  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  29.78 
 
 		 666 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3381  DNA ligase, NAD-dependent  28.71 
 
 		 714 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113379  hitchhiker  0.00670333 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  27.13 
 
 		 673 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2085  DNA ligase, NAD-dependent  27.41 
 
 		 699 aa  207  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  27.62 
 
 		 662 aa  207  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2016  DNA ligase, NAD-dependent  27.77 
 
 		 673 aa  207  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  28.69 
 
 		 715 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.51 
 
 		 648 aa  207  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  27.96 
 
 		 673 aa  207  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  27.36 
 
 		 703 aa  207  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0776  DNA ligase, NAD-dependent  29.33 
 
 		 662 aa  206  9e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1290  DNA ligase, NAD-dependent  28.14 
 
 		 714 aa  206  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  27.58 
 
 		 685 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0463  DNA ligase, NAD-dependent  28.78 
 
 		 684 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3645  DNA ligase, NAD-dependent  26.69 
 
 		 692 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  29.31 
 
 		 672 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  29.04 
 
 		 673 aa  205  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  28.79 
 
 		 670 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  26.78 
 
 		 672 aa  204  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1565  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.18 
 
 		 654 aa  204  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0182697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2093  DNA ligase, NAD-dependent  26.99 
 
 		 705 aa  204  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  27.13 
 
 		 706 aa  204  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0320  NAD dependent DNA ligase  26.95 
 
 		 691 aa  203  8e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  27.67 
 
 		 684 aa  203  8e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  27.69 
 
 		 690 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.85 
 
 		 697 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  27.16 
 
 		 691 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  29.09 
 
 		 670 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  29.04 
 
 		 663 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.81 
 
 		 669 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  26.81 
 
 		 670 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  27.6 
 
 		 671 aa  201  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  28.86 
 
 		 670 aa  200  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0451  DNA ligase, NAD-dependent  27.51 
 
 		 808 aa  200  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.950618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1762  DNA ligase, NAD-dependent  27.01 
 
 		 720 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654069  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  28.14 
 
 		 682 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.6 
 
 		 669 aa  198  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.6 
 
 		 669 aa  198  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  27.85 
 
 		 671 aa  198  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.6 
 
 		 669 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  26.98 
 
 		 700 aa  198  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1159  DNA ligase, NAD-dependent  28.04 
 
 		 704 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.227634  normal  0.637978 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1017  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.31 
 
 		 645 aa  198  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.682519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.75 
 
 		 669 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.44 
 
 		 669 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  27.23 
 
 		 714 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  27.92 
 
 		 683 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1062  NAD-dependent DNA ligase  27.8 
 
 		 716 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759691  normal  0.781607 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  27.13 
 
 		 681 aa  197  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.29 
 
 		 669 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  29 
 
 		 680 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.29 
 
 		 669 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.44 
 
 		 652 aa  195  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.29 
 
 		 669 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  27.47 
 
 		 699 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  27.58 
 
 		 665 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  27.61 
 
 		 667 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  27.61 
 
 		 667 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0351  DNA ligase, NAD-dependent  25.83 
 
 		 691 aa  194  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2086  DNA ligase, NAD-dependent  28.77 
 
 		 670 aa  194  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  26.71 
 
 		 668 aa  193  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.29 
 
 		 669 aa  193  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2023  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.45 
 
 		 647 aa  193  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000845936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  28.87 
 
 		 668 aa  193  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0423  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.83 
 
 		 660 aa  193  9e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  26.99 
 
 		 681 aa  193  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  26.56 
 
 		 672 aa  193  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1344  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.15 
 
 		 652 aa  193  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0984066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0427  DNA ligase, NAD-dependent  27.73 
 
 		 675 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.98 
 
 		 669 aa  193  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  27.33 
 
 		 700 aa  192  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  28.72 
 
 		 668 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  27.49 
 
 		 685 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  27.3 
 
 		 676 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  27.76 
 
 		 671 aa  191  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.5 
 
 		 669 aa  191  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  27.83 
 
 		 675 aa  191  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0728  DNA ligase, NAD-dependent  26.01 
 
 		 687 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.3 
 
 		 679 aa  191  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  25.6 
 
 		 675 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2628  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.82 
 
 		 693 aa  191  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.533906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  27.01 
 
 		 673 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0473  DNA ligase, NAD-dependent  27 
 
 		 686 aa  190  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>