More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0423 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0423  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 660 aa  1361    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.53 
 
 		 670 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  42.62 
 
 		 662 aa  515  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  43.88 
 
 		 662 aa  515  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.79 
 
 		 670 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.24 
 
 		 669 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  43.3 
 
 		 677 aa  505  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  41.88 
 
 		 672 aa  504  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.09 
 
 		 669 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.85 
 
 		 669 aa  501  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.09 
 
 		 669 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.09 
 
 		 669 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.94 
 
 		 669 aa  498  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.09 
 
 		 669 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.94 
 
 		 669 aa  498  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  41.37 
 
 		 663 aa  497  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  40.7 
 
 		 670 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  42.31 
 
 		 671 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.09 
 
 		 669 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.94 
 
 		 669 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  41.84 
 
 		 673 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  41.83 
 
 		 707 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.47 
 
 		 669 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  42.15 
 
 		 690 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  41.08 
 
 		 680 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  40.75 
 
 		 670 aa  492  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  40.98 
 
 		 711 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  41.98 
 
 		 671 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  40.96 
 
 		 663 aa  485  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  42.11 
 
 		 673 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  41.58 
 
 		 670 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  40.32 
 
 		 706 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 682 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  40.67 
 
 		 662 aa  484  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  41.99 
 
 		 688 aa  479  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  41.99 
 
 		 688 aa  479  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  41.39 
 
 		 672 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  39.67 
 
 		 708 aa  481  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  41.55 
 
 		 673 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  40.24 
 
 		 669 aa  476  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.79 
 
 		 670 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  39.59 
 
 		 700 aa  478  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  41.4 
 
 		 691 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  39.94 
 
 		 721 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  39.97 
 
 		 689 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  41.32 
 
 		 683 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  42.53 
 
 		 666 aa  475  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 668 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  40.34 
 
 		 673 aa  474  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.63 
 
 		 670 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.97 
 
 		 671 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  41.01 
 
 		 684 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  40.79 
 
 		 668 aa  472  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  41.49 
 
 		 683 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  39.7 
 
 		 690 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  40.73 
 
 		 668 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.63 
 
 		 670 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  39.52 
 
 		 691 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  39.82 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  39.18 
 
 		 699 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  40.3 
 
 		 671 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  38.73 
 
 		 668 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  40.85 
 
 		 673 aa  470  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  40.27 
 
 		 681 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  39.7 
 
 		 690 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  40.3 
 
 		 669 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  39.05 
 
 		 681 aa  469  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  39.88 
 
 		 694 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  40.42 
 
 		 685 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.06 
 
 		 671 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  40.12 
 
 		 671 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  40.03 
 
 		 677 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.91 
 
 		 671 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  40.18 
 
 		 675 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.06 
 
 		 671 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  39.33 
 
 		 670 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  40.06 
 
 		 671 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  39.46 
 
 		 672 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  39.88 
 
 		 680 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.12 
 
 		 671 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  41.39 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.06 
 
 		 671 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  39.05 
 
 		 670 aa  466  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  40.79 
 
 		 695 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.61 
 
 		 671 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.61 
 
 		 671 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  41.07 
 
 		 673 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.04 
 
 		 676 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.67 
 
 		 671 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  40.83 
 
 		 691 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  41.07 
 
 		 672 aa  465  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  39.57 
 
 		 670 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  38.74 
 
 		 667 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  41.08 
 
 		 746 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  41.26 
 
 		 669 aa  465  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.97 
 
 		 671 aa  465  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  39.64 
 
 		 668 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  41.2 
 
 		 691 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  38.74 
 
 		 667 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  40.61 
 
 		 684 aa  460  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>