More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0463 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0483  DNA ligase, NAD-dependent  60.71 
 
 		 674 aa  832    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0463  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 684 aa  1385    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1699  DNA ligase (NAD+)  60.97 
 
 		 677 aa  760    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.699894  normal  0.700726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  61.43 
 
 		 667 aa  834    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2016  DNA ligase, NAD-dependent  62.44 
 
 		 673 aa  833    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0427  DNA ligase, NAD-dependent  68.69 
 
 		 675 aa  944    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  60.87 
 
 		 676 aa  811    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  44.87 
 
 		 662 aa  579  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  46.39 
 
 		 670 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.88 
 
 		 670 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  45.29 
 
 		 663 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  43.34 
 
 		 670 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  45.81 
 
 		 672 aa  569  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  44.62 
 
 		 670 aa  572  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  45 
 
 		 666 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 659 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  45.84 
 
 		 670 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  44.46 
 
 		 681 aa  559  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  43.27 
 
 		 700 aa  552  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 684 aa  551  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.01 
 
 		 670 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  46.15 
 
 		 675 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  44.26 
 
 		 662 aa  549  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  46.03 
 
 		 671 aa  548  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  41.72 
 
 		 670 aa  545  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  44.11 
 
 		 669 aa  545  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.49 
 
 		 676 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  44.67 
 
 		 672 aa  545  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.73 
 
 		 679 aa  542  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2539  DNA ligase, NAD-dependent  42.73 
 
 		 696 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  42.58 
 
 		 668 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  45.81 
 
 		 694 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  45.31 
 
 		 673 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 		 673 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1926  hypothetical protein  42.73 
 
 		 671 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  44.79 
 
 		 672 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  43.79 
 
 		 669 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  43.68 
 
 		 668 aa  535  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  42.57 
 
 		 704 aa  535  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  45.16 
 
 		 673 aa  535  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  44.22 
 
 		 671 aa  535  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  43.24 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  42.82 
 
 		 677 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  43.68 
 
 		 683 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  44.41 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  43.54 
 
 		 726 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  42.54 
 
 		 664 aa  531  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  42.15 
 
 		 674 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  41.83 
 
 		 688 aa  527  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  41.57 
 
 		 662 aa  525  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  45 
 
 		 673 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  41.83 
 
 		 688 aa  527  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  41.36 
 
 		 678 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.21 
 
 		 738 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  43.38 
 
 		 711 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  40.69 
 
 		 690 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  42.24 
 
 		 674 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 		 673 aa  522  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.98 
 
 		 669 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.84 
 
 		 669 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  42.75 
 
 		 668 aa  520  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.84 
 
 		 669 aa  519  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.06 
 
 		 669 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  45.95 
 
 		 683 aa  522  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  42.35 
 
 		 663 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  40.4 
 
 		 690 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  41.74 
 
 		 685 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.98 
 
 		 669 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5111  DNA ligase, NAD-dependent  41.71 
 
 		 695 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246917  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.69 
 
 		 669 aa  519  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  44.82 
 
 		 678 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  41.33 
 
 		 670 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.67 
 
 		 669 aa  521  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.13 
 
 		 669 aa  522  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.91 
 
 		 669 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  42.05 
 
 		 689 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  43.38 
 
 		 674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  41.68 
 
 		 684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.91 
 
 		 669 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.76 
 
 		 669 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  42.42 
 
 		 680 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  41.53 
 
 		 685 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.41 
 
 		 680 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  41.78 
 
 		 706 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  41.68 
 
 		 685 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  43.83 
 
 		 712 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.55 
 
 		 697 aa  515  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  41.68 
 
 		 685 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.76 
 
 		 669 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  42.14 
 
 		 688 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  41.75 
 
 		 683 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.18 
 
 		 680 aa  510  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 671 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  42.28 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 671 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  41.37 
 
 		 690 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.52 
 
 		 690 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.52 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  42.67 
 
 		 693 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  41.64 
 
 		 690 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>