More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2023 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1371  DNA ligase, NAD-dependent  59.6 
 
 		 648 aa  782    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00123694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0689  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.16 
 
 		 647 aa  776    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0673  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.22 
 
 		 651 aa  761    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1017  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.25 
 
 		 645 aa  791    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.682519  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1083  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.31 
 
 		 647 aa  779    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.88186  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1344  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.38 
 
 		 652 aa  692    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0984066  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1565  NAD-dependent DNA ligase LigA  79.26 
 
 		 654 aa  1050    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0182697  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2023  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 647 aa  1312    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000845936  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0614  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.31 
 
 		 647 aa  775    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1112  NAD-dependent DNA ligase LigA  64.96 
 
 		 645 aa  838    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00321747  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  41.59 
 
 		 673 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  42.02 
 
 		 663 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  42.34 
 
 		 672 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  43.06 
 
 		 671 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  41.5 
 
 		 671 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  42.25 
 
 		 671 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  41.49 
 
 		 683 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  40.15 
 
 		 673 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  40.15 
 
 		 671 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  40.49 
 
 		 673 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  41.19 
 
 		 669 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  41.29 
 
 		 681 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.12 
 
 		 670 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  41.64 
 
 		 726 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.12 
 
 		 648 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  41.72 
 
 		 671 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  39.82 
 
 		 673 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  40.03 
 
 		 677 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  41.72 
 
 		 671 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  40.3 
 
 		 672 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 		 670 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  41.09 
 
 		 670 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.29 
 
 		 684 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  39.67 
 
 		 690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  40.48 
 
 		 672 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  40.8 
 
 		 718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  40.57 
 
 		 672 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  41.52 
 
 		 690 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.21 
 
 		 669 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  39.06 
 
 		 685 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2541  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.09 
 
 		 662 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00953923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2245  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.94 
 
 		 662 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  41.72 
 
 		 690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.72 
 
 		 690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  42.47 
 
 		 678 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 685 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  41.3 
 
 		 689 aa  445  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  39.82 
 
 		 711 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  38.76 
 
 		 674 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1227  DNA ligase, NAD-dependent  39.18 
 
 		 656 aa  442  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  40.09 
 
 		 680 aa  444  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  41.07 
 
 		 670 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  41.56 
 
 		 691 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.72 
 
 		 670 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  39.09 
 
 		 659 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.6 
 
 		 669 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  39.97 
 
 		 666 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  39.45 
 
 		 694 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.91 
 
 		 671 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.94 
 
 		 669 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.09 
 
 		 669 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.79 
 
 		 669 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  40.64 
 
 		 662 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.91 
 
 		 671 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.94 
 
 		 669 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  39.91 
 
 		 671 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  40.24 
 
 		 670 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  40.12 
 
 		 685 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.64 
 
 		 669 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.61 
 
 		 671 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.91 
 
 		 671 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  39.91 
 
 		 671 aa  435  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.94 
 
 		 669 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.94 
 
 		 669 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.76 
 
 		 669 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.76 
 
 		 671 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.94 
 
 		 669 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  36.8 
 
 		 678 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0320  NAD dependent DNA ligase  39.97 
 
 		 691 aa  435  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.76 
 
 		 671 aa  435  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  38.88 
 
 		 668 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  40.34 
 
 		 663 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  40.59 
 
 		 674 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  40.12 
 
 		 685 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0351  DNA ligase, NAD-dependent  40.24 
 
 		 691 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.91 
 
 		 671 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  38.04 
 
 		 674 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0473  DNA ligase, NAD-dependent  40.49 
 
 		 686 aa  435  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  40.4 
 
 		 673 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.94 
 
 		 669 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  41.07 
 
 		 683 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  40.03 
 
 		 711 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.94 
 
 		 671 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.22 
 
 		 679 aa  432  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  39.79 
 
 		 699 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.18 
 
 		 669 aa  432  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.94 
 
 		 671 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.94 
 
 		 671 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  40.27 
 
 		 670 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  0.00000000308694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>