More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1112 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0689  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.91 
 
 		 647 aa  768    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0673  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.38 
 
 		 651 aa  765    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0614  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.38 
 
 		 647 aa  770    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1565  NAD-dependent DNA ligase LigA  62.83 
 
 		 654 aa  833    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0182697  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1017  NAD-dependent DNA ligase LigA  63.2 
 
 		 645 aa  841    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.682519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1344  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.62 
 
 		 652 aa  657    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0984066  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1083  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.38 
 
 		 647 aa  770    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.88186  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2023  NAD-dependent DNA ligase LigA  64.96 
 
 		 647 aa  853    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000845936  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1371  DNA ligase, NAD-dependent  55.61 
 
 		 648 aa  735    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00123694  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1112  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 645 aa  1308    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00321747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  40.67 
 
 		 663 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  41.61 
 
 		 673 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.87 
 
 		 648 aa  464  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  41.3 
 
 		 673 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  40.43 
 
 		 673 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.74 
 
 		 670 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  39.52 
 
 		 672 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  39.94 
 
 		 671 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  37.73 
 
 		 673 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  38.64 
 
 		 694 aa  450  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  36.99 
 
 		 670 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  39.11 
 
 		 689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  38.8 
 
 		 685 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  38.16 
 
 		 671 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  38.16 
 
 		 671 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2541  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.3 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00953923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2245  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.3 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  38.43 
 
 		 683 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  38.96 
 
 		 690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  38.96 
 
 		 690 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 		 671 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  39.47 
 
 		 673 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  37.95 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  37.8 
 
 		 691 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  37.5 
 
 		 690 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  38.79 
 
 		 688 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  37.95 
 
 		 746 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  37.86 
 
 		 681 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  37.31 
 
 		 668 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  37.95 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  38.96 
 
 		 691 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  38.28 
 
 		 659 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  39.1 
 
 		 672 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.1 
 
 		 652 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  40.68 
 
 		 670 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  38.83 
 
 		 667 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  37.65 
 
 		 691 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  36.54 
 
 		 671 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.81 
 
 		 670 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  37.5 
 
 		 691 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  38.83 
 
 		 667 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  38.18 
 
 		 688 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  39.04 
 
 		 691 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  39.97 
 
 		 662 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  37.74 
 
 		 691 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  38.24 
 
 		 690 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  38.58 
 
 		 685 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  37.04 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  37.04 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  37.2 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  37.61 
 
 		 683 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  38.98 
 
 		 668 aa  436  1e-121  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  37.04 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  38.31 
 
 		 669 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  37.04 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  37.2 
 
 		 691 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  38.43 
 
 		 685 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  38.56 
 
 		 670 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  37.65 
 
 		 691 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  37.2 
 
 		 691 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  36.69 
 
 		 668 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  38.58 
 
 		 685 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  37.82 
 
 		 711 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  37.46 
 
 		 672 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.91 
 
 		 670 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  38.75 
 
 		 670 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  0.00000000308694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.19 
 
 		 669 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  38.13 
 
 		 665 aa  430  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.23 
 
 		 669 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  38.76 
 
 		 681 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.23 
 
 		 669 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  36.3 
 
 		 718 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.23 
 
 		 669 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  37.77 
 
 		 673 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  38.4 
 
 		 686 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  37.43 
 
 		 707 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  39.51 
 
 		 674 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.75 
 
 		 669 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.38 
 
 		 669 aa  432  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1227  DNA ligase, NAD-dependent  38.64 
 
 		 656 aa  429  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  37.69 
 
 		 670 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3466  DNA ligase, NAD-dependent  37.46 
 
 		 689 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.07 
 
 		 669 aa  429  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.07 
 
 		 669 aa  429  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  36.16 
 
 		 671 aa  428  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  37.04 
 
 		 726 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.07 
 
 		 669 aa  429  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.16 
 
 		 673 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  38.17 
 
 		 670 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.07 
 
 		 669 aa  429  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>