More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1344 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1371  DNA ligase, NAD-dependent  58.76 
 
 		 648 aa  775    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00123694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0689  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.57 
 
 		 647 aa  670    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0614  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.41 
 
 		 647 aa  665    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1565  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.85 
 
 		 654 aa  685    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0182697  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1344  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 652 aa  1336    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0984066  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1017  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.85 
 
 		 645 aa  661    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.682519  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2023  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.38 
 
 		 647 aa  705    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000845936  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1083  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.1 
 
 		 647 aa  665    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.88186  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1112  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.62 
 
 		 645 aa  654    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00321747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0673  NAD-dependent DNA ligase LigA  53.01 
 
 		 651 aa  680    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.77 
 
 		 670 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  41.8 
 
 		 670 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  41.44 
 
 		 671 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.17 
 
 		 669 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.14 
 
 		 670 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.02 
 
 		 669 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.23 
 
 		 669 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.02 
 
 		 669 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  41.08 
 
 		 673 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 670 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.08 
 
 		 669 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.87 
 
 		 669 aa  485  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.72 
 
 		 669 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.72 
 
 		 669 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  41.49 
 
 		 663 aa  485  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  40.15 
 
 		 671 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.87 
 
 		 669 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  42.22 
 
 		 673 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.42 
 
 		 669 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  39.51 
 
 		 670 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  40.48 
 
 		 672 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.33 
 
 		 679 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  39.85 
 
 		 672 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0451  DNA ligase, NAD-dependent  38.8 
 
 		 808 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.950618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  39.49 
 
 		 694 aa  476  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  40.68 
 
 		 691 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  40.68 
 
 		 691 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2093  DNA ligase, NAD-dependent  39.33 
 
 		 705 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  40.24 
 
 		 691 aa  475  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  40.68 
 
 		 691 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  40.68 
 
 		 691 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  40.36 
 
 		 683 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  40.68 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  41.9 
 
 		 673 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  40.53 
 
 		 691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.64 
 
 		 669 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  40.18 
 
 		 659 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  40.68 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  40.28 
 
 		 674 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  41.11 
 
 		 746 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  40.52 
 
 		 683 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  39.97 
 
 		 674 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  41.11 
 
 		 691 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  41.9 
 
 		 673 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  40.31 
 
 		 667 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  41.11 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  40.96 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  40.72 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  40.81 
 
 		 691 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  40.96 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  40.31 
 
 		 667 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  40.86 
 
 		 672 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  39.79 
 
 		 672 aa  465  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  39.33 
 
 		 690 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  40.27 
 
 		 690 aa  465  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  39.66 
 
 		 678 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  39.52 
 
 		 681 aa  462  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.5 
 
 		 671 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  40.03 
 
 		 711 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  41.5 
 
 		 671 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.27 
 
 		 670 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  39.57 
 
 		 673 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 		 672 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  41.42 
 
 		 688 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.28 
 
 		 774 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  40.99 
 
 		 690 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.5 
 
 		 671 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  41.5 
 
 		 671 aa  458  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  38.32 
 
 		 677 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  40.99 
 
 		 689 aa  458  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.35 
 
 		 671 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  39.53 
 
 		 668 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.35 
 
 		 671 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  41.35 
 
 		 688 aa  459  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  40.59 
 
 		 671 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.12 
 
 		 670 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  40.83 
 
 		 690 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.5 
 
 		 671 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.12 
 
 		 670 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.39 
 
 		 673 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.21 
 
 		 648 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  40.99 
 
 		 691 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.5 
 
 		 671 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  39.47 
 
 		 668 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  38.73 
 
 		 708 aa  453  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 		 691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.57 
 
 		 671 aa  455  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.46 
 
 		 670 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1425  DNA ligase, NAD-dependent  37.34 
 
 		 712 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.54 
 
 		 684 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>