More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2645 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2085  DNA ligase, NAD-dependent  59.09 
 
 		 699 aa  783    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2645  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 710 aa  1407    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2628  NAD-dependent DNA ligase LigA  64.51 
 
 		 693 aa  848    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.533906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1084  NAD-dependent DNA ligase LigA  64.5 
 
 		 700 aa  853    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.419808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3645  DNA ligase, NAD-dependent  61.26 
 
 		 692 aa  803    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  51.34 
 
 		 673 aa  566  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  47.08 
 
 		 711 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  48.29 
 
 		 678 aa  545  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  45.95 
 
 		 683 aa  538  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  44.44 
 
 		 673 aa  535  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  46.21 
 
 		 706 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  44.14 
 
 		 670 aa  532  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  44.31 
 
 		 672 aa  523  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  47.57 
 
 		 673 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  44.15 
 
 		 675 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 685 aa  524  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  44.36 
 
 		 674 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  43.42 
 
 		 672 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  43.65 
 
 		 690 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  45.37 
 
 		 675 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  45 
 
 		 670 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  47.34 
 
 		 693 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  44.54 
 
 		 689 aa  515  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  45.37 
 
 		 711 aa  512  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  46.17 
 
 		 669 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  44.54 
 
 		 690 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  44.01 
 
 		 670 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  45.07 
 
 		 685 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  38.6 
 
 		 662 aa  511  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  44.92 
 
 		 685 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  45.55 
 
 		 690 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  43.54 
 
 		 677 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  44.96 
 
 		 670 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  0.00000000308694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.17 
 
 		 670 aa  510  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  44.69 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  44.77 
 
 		 685 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.17 
 
 		 670 aa  509  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  45.96 
 
 		 694 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  45.24 
 
 		 721 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.1 
 
 		 673 aa  508  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  44.39 
 
 		 690 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.17 
 
 		 670 aa  509  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.69 
 
 		 670 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  45.24 
 
 		 707 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  42.24 
 
 		 673 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  43.35 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  44.74 
 
 		 685 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  44.91 
 
 		 681 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  41.94 
 
 		 673 aa  502  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  47.1 
 
 		 683 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  42.71 
 
 		 672 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  44.01 
 
 		 670 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 671 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  43.05 
 
 		 668 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.98 
 
 		 681 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.77 
 
 		 669 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  43.56 
 
 		 670 aa  498  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  43.35 
 
 		 671 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  43.95 
 
 		 668 aa  499  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.79 
 
 		 682 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  41.02 
 
 		 663 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  43.86 
 
 		 671 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.43 
 
 		 673 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.72 
 
 		 684 aa  499  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.26 
 
 		 681 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  43.56 
 
 		 671 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.56 
 
 		 671 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  42.52 
 
 		 668 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  44.61 
 
 		 691 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.56 
 
 		 671 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  43.92 
 
 		 691 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  44.43 
 
 		 697 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.39 
 
 		 669 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.56 
 
 		 671 aa  492  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.41 
 
 		 671 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  43.61 
 
 		 670 aa  492  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  44.51 
 
 		 703 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.15 
 
 		 671 aa  492  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.41 
 
 		 671 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  44.62 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.56 
 
 		 671 aa  492  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.15 
 
 		 671 aa  492  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  44 
 
 		 671 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  43.56 
 
 		 671 aa  492  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.15 
 
 		 671 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  38.74 
 
 		 681 aa  492  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.15 
 
 		 671 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  44.02 
 
 		 682 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  42.43 
 
 		 677 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  41.97 
 
 		 688 aa  488  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  41.97 
 
 		 688 aa  488  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  44.48 
 
 		 691 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  44.33 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0693  DNA ligase, NAD-dependent  43.65 
 
 		 687 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.600829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0728  DNA ligase, NAD-dependent  42.75 
 
 		 687 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0729  DNA ligase, NAD-dependent  42.9 
 
 		 687 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>