More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0004 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 675 aa  1365    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  47.92 
 
 		 672 aa  570  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  45.4 
 
 		 677 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  45.43 
 
 		 682 aa  555  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  45.31 
 
 		 683 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  44.96 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  43.83 
 
 		 670 aa  555  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  44.84 
 
 		 672 aa  548  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.28 
 
 		 670 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  44 
 
 		 670 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2058  DNA ligase, NAD-dependent  44.71 
 
 		 708 aa  544  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  44.85 
 
 		 684 aa  542  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  42.81 
 
 		 663 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  43.03 
 
 		 662 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  43.75 
 
 		 672 aa  535  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 681 aa  531  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  42.09 
 
 		 673 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.51 
 
 		 670 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  43.13 
 
 		 669 aa  520  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  43.07 
 
 		 673 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  43.49 
 
 		 694 aa  522  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 668 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  42.71 
 
 		 668 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  41.54 
 
 		 671 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  41.16 
 
 		 662 aa  513  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.39 
 
 		 679 aa  514  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  43.06 
 
 		 683 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  40.69 
 
 		 662 aa  509  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  41.93 
 
 		 671 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  40.7 
 
 		 707 aa  509  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  44.85 
 
 		 666 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  39.94 
 
 		 670 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2844  DNA ligase, NAD-dependent  42.11 
 
 		 707 aa  509  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.764742  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  41 
 
 		 673 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  40.77 
 
 		 670 aa  507  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  42.52 
 
 		 690 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  42.06 
 
 		 706 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  41.97 
 
 		 678 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  42.81 
 
 		 661 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.91 
 
 		 671 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  42.65 
 
 		 726 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  41.48 
 
 		 711 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  42.8 
 
 		 700 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 718 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  41.89 
 
 		 675 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.91 
 
 		 671 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.13 
 
 		 670 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  42.18 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.91 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0696  DNA ligase, NAD-dependent  43.03 
 
 		 684 aa  504  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2841  DNA ligase, NAD-dependent  42.32 
 
 		 732 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.23 
 
 		 669 aa  500  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.91 
 
 		 671 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  39.59 
 
 		 668 aa  501  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  41.47 
 
 		 711 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.91 
 
 		 671 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  40.96 
 
 		 683 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  40.67 
 
 		 675 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.91 
 
 		 671 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  39.79 
 
 		 672 aa  502  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  39.52 
 
 		 669 aa  499  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  42.67 
 
 		 694 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.82 
 
 		 669 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  39.5 
 
 		 668 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.62 
 
 		 671 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  41.62 
 
 		 671 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.68 
 
 		 669 aa  498  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.68 
 
 		 669 aa  497  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.68 
 
 		 669 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.53 
 
 		 669 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.84 
 
 		 676 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.98 
 
 		 670 aa  499  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  40.46 
 
 		 749 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0939  DNA ligase (NAD+)  42.75 
 
 		 698 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.8 
 
 		 682 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  41.29 
 
 		 691 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.62 
 
 		 671 aa  497  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.04 
 
 		 738 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.47 
 
 		 671 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  40.61 
 
 		 691 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.62 
 
 		 671 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  41.65 
 
 		 691 aa  498  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  42.03 
 
 		 674 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  44.78 
 
 		 693 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.98 
 
 		 670 aa  499  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  42.27 
 
 		 674 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.8 
 
 		 684 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  41.62 
 
 		 671 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  43.79 
 
 		 673 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.62 
 
 		 671 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  40.67 
 
 		 691 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  40.3 
 
 		 681 aa  497  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.62 
 
 		 671 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  43.2 
 
 		 707 aa  498  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  40.82 
 
 		 691 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  40.86 
 
 		 688 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  42.82 
 
 		 693 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.68 
 
 		 669 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  40.61 
 
 		 691 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>