More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01666 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  100 
 
 		 969 aa  1976    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  36.38 
 
 		 1020 aa  593  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 966 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  32.64 
 
 		 961 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 948 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 		 929 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 1040 aa  389  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 958 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 958 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 935 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 965 aa  341  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 946 aa  337  9e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 976 aa  328  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 907 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 907 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 947 aa  313  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 935 aa  311  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 951 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 924 aa  310  9e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 967 aa  303  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 966 aa  300  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 935 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 935 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 935 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 930 aa  297  6e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.66 
 
 		 966 aa  296  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 957 aa  296  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.14 
 
 		 936 aa  296  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 930 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 930 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 869 aa  290  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 944 aa  289  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 914 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 987 aa  283  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 912 aa  282  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 976 aa  281  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 897 aa  273  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 969 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 933 aa  273  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1228  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 1057 aa  272  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0919786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 937 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 981 aa  270  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 952 aa  270  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 951 aa  269  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 998 aa  264  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 966 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 981 aa  263  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 873 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 910 aa  258  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 944 aa  257  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 985 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 922 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 873 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 974 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 1007 aa  250  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 1007 aa  250  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 953 aa  249  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 975 aa  249  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1007 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.4 
 
 		 1007 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 938 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1009 aa  244  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 1088 aa  243  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.42 
 
 		 839 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 904 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1028 aa  241  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 1015 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 843 aa  240  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 836 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 904 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.32 
 
 		 853 aa  238  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 904 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 904 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 853 aa  237  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 853 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 853 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 920 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 841 aa  234  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 939 aa  234  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 838 aa  233  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 964 aa  233  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 1041 aa  232  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 853 aa  232  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 855 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 901 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.98 
 
 		 914 aa  226  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 842 aa  224  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 940 aa  221  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 824 aa  221  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 855 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 982 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 1004 aa  211  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 944 aa  201  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 709 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 817 aa  198  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 927 aa  198  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 869 aa  197  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 924 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 928 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 924 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>