196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2860 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4989  NB-ARC  45 
 
 		 1243 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2860  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 1144 aa  2303    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6109  hypothetical protein  33.29 
 
 		 1567 aa  292  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3253  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1492 aa  151  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94955  hitchhiker  0.000665346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  29.1 
 
 		 969 aa  151  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3131  NB-ARC domain-containing protein  32.48 
 
 		 399 aa  139  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  31.22 
 
 		 1280 aa  127  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  31.39 
 
 		 1523 aa  128  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  23.3 
 
 		 1438 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.64 
 
 		 1454 aa  122  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.12 
 
 		 1484 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.14 
 
 		 1027 aa  102  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5126  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1531 aa  102  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  26.41 
 
 		 1108 aa  99  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  25.46 
 
 		 1014 aa  94.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  28.65 
 
 		 1010 aa  89.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  30.19 
 
 		 788 aa  88.6  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1427 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  29.85 
 
 		 1088 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  28.71 
 
 		 990 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  26.72 
 
 		 1022 aa  86.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1958 aa  84.7  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  25.71 
 
 		 990 aa  84.7  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 850 aa  84  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1587  TIR protein  55.07 
 
 		 275 aa  83.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0118312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  26.12 
 
 		 992 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  29.02 
 
 		 1003 aa  82.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  27.8 
 
 		 971 aa  82  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 941 aa  81.6  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  28.61 
 
 		 940 aa  81.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2958  hypothetical protein  32.05 
 
 		 456 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0140305  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  27.74 
 
 		 1021 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 1024 aa  81.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  29.25 
 
 		 1054 aa  79.7  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  29.33 
 
 		 954 aa  79.7  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  27.22 
 
 		 810 aa  79.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  26.4 
 
 		 981 aa  79.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  46.91 
 
 		 778 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  26.09 
 
 		 1138 aa  78.2  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  26.44 
 
 		 1008 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  25.59 
 
 		 806 aa  77  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  26.83 
 
 		 1003 aa  77  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  27.67 
 
 		 838 aa  75.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 1048 aa  74.7  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  25.38 
 
 		 1030 aa  74.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 1071 aa  73.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2043  tetratricopeptide domain-containing protein  26.88 
 
 		 1497 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  29.36 
 
 		 814 aa  73.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  28.8 
 
 		 981 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  26.43 
 
 		 930 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  27.3 
 
 		 715 aa  73.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  29.95 
 
 		 921 aa  72.8  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.22 
 
 		 1013 aa  72.4  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1502 aa  71.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  26.14 
 
 		 913 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  25.78 
 
 		 915 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 907 aa  70.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  25.15 
 
 		 995 aa  70.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2079  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  28.57 
 
 		 737 aa  70.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  25.31 
 
 		 919 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  25.07 
 
 		 926 aa  70.1  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  26.53 
 
 		 827 aa  69.3  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  27.12 
 
 		 931 aa  68.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  26.16 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  26.56 
 
 		 907 aa  68.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 776 aa  67.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  28.12 
 
 		 982 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  31.72 
 
 		 970 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  28.72 
 
 		 996 aa  65.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  30.16 
 
 		 775 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3373  NB-ARC domain protein  32.24 
 
 		 992 aa  65.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  25.43 
 
 		 937 aa  65.1  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  26.65 
 
 		 1034 aa  65.1  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 953 aa  64.7  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  29.3 
 
 		 797 aa  64.7  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5170  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1513 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  24.23 
 
 		 964 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  26 
 
 		 783 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  26.75 
 
 		 1033 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 654 aa  63.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 924 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  27.65 
 
 		 621 aa  63.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0354  hypothetical protein  28.8 
 
 		 142 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  24.18 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1869 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1105 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  26.57 
 
 		 790 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 1319 aa  62  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  28.76 
 
 		 1030 aa  62  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  25.12 
 
 		 908 aa  62  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  25.32 
 
 		 392 aa  62  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  26.39 
 
 		 1001 aa  61.6  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  27.08 
 
 		 950 aa  61.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 1346 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  31.11 
 
 		 1020 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54586  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1525 aa  61.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  24.45 
 
 		 978 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  27.17 
 
 		 962 aa  61.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  26.15 
 
 		 1003 aa  60.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>