45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54586 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_54586  hypothetical protein  100 
 
 		 1525 aa  3147    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  29.91 
 
 		 2327 aa  78.6  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 		 1288 aa  63.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.09 
 
 		 1454 aa  63.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 814 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 924 aa  61.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1404 aa  58.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 843 aa  57.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.01 
 
 		 2145 aa  56.6  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2860  NB-ARC domain protein  25.19 
 
 		 1144 aa  56.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  23.29 
 
 		 807 aa  55.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 568 aa  55.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 1424 aa  55.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 		 568 aa  55.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48471  predicted protein  27.55 
 
 		 495 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00174392  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1105 aa  53.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1550 aa  53.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.83 
 
 		 1523 aa  53.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  21.39 
 
 		 1131 aa  52.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.83 
 
 		 740 aa  52.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.8 
 
 		 732 aa  51.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 284 aa  51.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  22.65 
 
 		 1435 aa  51.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1123 aa  49.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  27.97 
 
 		 969 aa  49.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.93 
 
 		 1186 aa  48.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.84 
 
 		 1228 aa  48.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 		 767 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.47 
 
 		 672 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1215 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1088 aa  47.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  22.64 
 
 		 694 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  27.91 
 
 		 848 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4168  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 326 aa  47.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4122  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.69 
 
 		 1126 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289873  decreased coverage  0.00939921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  22.83 
 
 		 825 aa  47  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 751 aa  46.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  23.11 
 
 		 1731 aa  46.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  30.28 
 
 		 1044 aa  46.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  23.81 
 
 		 708 aa  46.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.96 
 
 		 991 aa  46.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 953 aa  46.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  21.37 
 
 		 1438 aa  45.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.22 
 
 		 493 aa  45.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  24.69 
 
 		 2413 aa  45.1  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>