12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6109 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6109  hypothetical protein  100 
 
 		 1567 aa  3023    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4989  NB-ARC  44.2 
 
 		 1243 aa  447  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3253  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1492 aa  399  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94955  hitchhiker  0.000665346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2860  NB-ARC domain protein  34.1 
 
 		 1144 aa  286  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2958  hypothetical protein  29.72 
 
 		 456 aa  105  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0140305  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2079  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  30.83 
 
 		 737 aa  82.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5170  hypothetical protein  25 
 
 		 1513 aa  72.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5126  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1531 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5166  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.75 
 
 		 1494 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0065  hypothetical protein  30.99 
 
 		 230 aa  55.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0354  hypothetical protein  26.09 
 
 		 142 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2043  tetratricopeptide domain-containing protein  22.38 
 
 		 1497 aa  45.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>