17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3253 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6109  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1567 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3253  hypothetical protein  100 
 
 		 1492 aa  2833    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94955  hitchhiker  0.000665346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4989  NB-ARC  45.53 
 
 		 1243 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2860  NB-ARC domain protein  34.96 
 
 		 1144 aa  280  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1958 aa  94.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3586  hypothetical protein  63.89 
 
 		 127 aa  90.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2958  hypothetical protein  27.94 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0140305  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5170  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1513 aa  64.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5126  hypothetical protein  24 
 
 		 1531 aa  57  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0173  hypothetical protein  46.02 
 
 		 109 aa  53.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000559981  hitchhiker  0.0000526523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.71 
 
 		 931 aa  52  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.57 
 
 		 928 aa  49.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0172  hypothetical protein  63.64 
 
 		 131 aa  48.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000349982  hitchhiker  0.00023245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2043  tetratricopeptide domain-containing protein  24.61 
 
 		 1497 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  23.57 
 
 		 1742 aa  46.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0354  hypothetical protein  31.51 
 
 		 142 aa  46.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  32.04 
 
 		 790 aa  45.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>