289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3378 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  54.37 
 
 		 891 aa  951    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  63.29 
 
 		 604 aa  797    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  49.67 
 
 		 873 aa  823    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  62.32 
 
 		 903 aa  1110    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 919 aa  1876    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.55 
 
 		 986 aa  712    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  60.51 
 
 		 922 aa  1115    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.63 
 
 		 805 aa  625  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.27 
 
 		 813 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  39 
 
 		 827 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  41.72 
 
 		 928 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  40.53 
 
 		 1015 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  38.7 
 
 		 806 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.73 
 
 		 824 aa  526  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  38.06 
 
 		 832 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  35.75 
 
 		 1355 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.75 
 
 		 794 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  37.63 
 
 		 932 aa  445  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  33.25 
 
 		 1185 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  34.68 
 
 		 961 aa  438  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 		 984 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 		 925 aa  422  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.21 
 
 		 811 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.86 
 
 		 1781 aa  417  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.79 
 
 		 805 aa  418  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  33.37 
 
 		 964 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  31.57 
 
 		 815 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.47 
 
 		 837 aa  366  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 858 aa  353  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 806 aa  352  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  31.57 
 
 		 825 aa  350  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 		 807 aa  347  7e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  30.82 
 
 		 799 aa  345  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  29.93 
 
 		 859 aa  342  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.37 
 
 		 808 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  60.23 
 
 		 309 aa  324  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.47 
 
 		 787 aa  317  7e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.47 
 
 		 1093 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.53 
 
 		 882 aa  269  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  37.65 
 
 		 829 aa  257  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  36.3 
 
 		 655 aa  243  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.55 
 
 		 862 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.65 
 
 		 750 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  28.09 
 
 		 897 aa  225  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  29.49 
 
 		 888 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  27.26 
 
 		 707 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  23.26 
 
 		 743 aa  195  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  28.53 
 
 		 704 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.6 
 
 		 858 aa  184  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.3 
 
 		 803 aa  178  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  23.88 
 
 		 848 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 		 754 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  24.83 
 
 		 1171 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 766 aa  164  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  30.54 
 
 		 785 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.32 
 
 		 747 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.15 
 
 		 824 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.83 
 
 		 748 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.32 
 
 		 717 aa  154  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 781 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 979 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.84 
 
 		 781 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  27.87 
 
 		 763 aa  144  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  28.08 
 
 		 894 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  24.93 
 
 		 1175 aa  142  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 		 951 aa  141  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  27.11 
 
 		 1044 aa  141  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  27.57 
 
 		 670 aa  139  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.87 
 
 		 686 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  27.85 
 
 		 1076 aa  138  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.7 
 
 		 804 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.66 
 
 		 738 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 1079 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  35.48 
 
 		 233 aa  135  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25.94 
 
 		 804 aa  134  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.61 
 
 		 1036 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.69 
 
 		 920 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  26.87 
 
 		 1112 aa  133  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.04 
 
 		 607 aa  132  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  27.95 
 
 		 512 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  28.37 
 
 		 1019 aa  131  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  26.42 
 
 		 577 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 1094 aa  128  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.02 
 
 		 1129 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  27.61 
 
 		 1043 aa  127  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.89 
 
 		 1264 aa  127  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.81 
 
 		 913 aa  126  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.32 
 
 		 1329 aa  126  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 1049 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  25.29 
 
 		 1046 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 1043 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  28.71 
 
 		 587 aa  125  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  24.15 
 
 		 1035 aa  125  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  27.33 
 
 		 598 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.22 
 
 		 1053 aa  124  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25 
 
 		 596 aa  124  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  23.76 
 
 		 1455 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 1017 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 1077 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  27.25 
 
 		 1020 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>