More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1379 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1379  isocitrate dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  709    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  55.19 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  53.49 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.38 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.84 
 
 		 335 aa  255  9e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.3 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  41.45 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.39 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  40.64 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  39.77 
 
 		 335 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  39.77 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  39.77 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  39.77 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  39.77 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  39.77 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  39.77 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  38.64 
 
 		 335 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.8 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  39.47 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  40.35 
 
 		 336 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  39.18 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  39.16 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.05 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  38.35 
 
 		 335 aa  222  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  38.6 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.6 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  37.13 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.55 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  37.13 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  39.07 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.39 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.01 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  37.06 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.06 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.58 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.12 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  36.78 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  37.86 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.53 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.54 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  38.22 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.17 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.46 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.26 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  36.5 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.33 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.12 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.69 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.54 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.66 
 
 		 342 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.6 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.26 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.22 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.28 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.28 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  37.31 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  35.91 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.99 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  34.91 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  39.17 
 
 		 335 aa  196  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  36.42 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  38.37 
 
 		 482 aa  195  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  36.42 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.65 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  36.34 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  38.87 
 
 		 482 aa  192  6e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  32.21 
 
 		 389 aa  192  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.86 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  36.91 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  36.47 
 
 		 480 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  37.93 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  37.5 
 
 		 471 aa  189  5.999999999999999e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  33.98 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.47 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.57 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.62 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.05 
 
 		 343 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  36.81 
 
 		 478 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  34.2 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.72 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.08 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.98 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.42 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.86 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  34.85 
 
 		 456 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.84 
 
 		 336 aa  180  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.83 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.79 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.39 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  34.48 
 
 		 481 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.63 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  34.51 
 
 		 482 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  33.86 
 
 		 480 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>