More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0952 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  78.57 
 
 		 233 aa  338  5e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  68.2 
 
 		 221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  67.28 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  67.28 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  62.73 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  58.26 
 
 		 223 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  52.06 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  54.75 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  44.95 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  53.85 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  47.49 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  43.89 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  46.53 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  47.69 
 
 		 217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  45.97 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  41.1 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  44.61 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  41.67 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  42.23 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  47.09 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  44.34 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  41.36 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  39.81 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  48.64 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  46.83 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  40.85 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  43.33 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  34.55 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 337 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  37.38 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  34.86 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  40.36 
 
 		 225 aa  128  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  37.95 
 
 		 225 aa  128  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  44.07 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  38.51 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  35.71 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  35.21 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  33.18 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  38.64 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  43.02 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  27.73 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.88 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  34.3 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.73 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  37.57 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  37.74 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 245 aa  95.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.62 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  35.39 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.36 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.07 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.56 
 
 		 259 aa  92  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.71 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  35.76 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  29.56 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.29 
 
 		 263 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  36.28 
 
 		 251 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  88.6  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.78 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.78 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  29.34 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  27.44 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.83 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  35.06 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  29.06 
 
 		 258 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  25.54 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  33.64 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  28.02 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  29.86 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.86 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.43 
 
 		 251 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.81 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.86 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>