199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2134 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  64.86 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  63.98 
 
 		 194 aa  222  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  60.77 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  59.67 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3102  regulatory protein TetR  64.32 
 
 		 187 aa  210  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 191 aa  209  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  56.91 
 
 		 182 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  61.58 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 181 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0043  transcriptional regulator, TetR family  49.19 
 
 		 188 aa  154  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 180 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3845  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  26.8 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.69 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 201 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2272  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  24.02 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  23.53 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  26.7 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 209 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  28.06 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 209 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  26.61 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  23.5 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 233 aa  44.7  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  32.56 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>