30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2272 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2272  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010580  Bind_3845  TetR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1648  hypothetical protein  43.17 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273732 
 
 
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NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
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NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  19.66 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
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NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  20.86 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
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NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  19.16 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
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NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
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NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
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NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 196 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  22.02 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
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