111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0863 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 842 aa  1675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1039  hypothetical protein  42.41 
 
 		 473 aa  321  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  58.23 
 
 		 288 aa  307  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  55.43 
 
 		 284 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3767  putative membrane protein of unknown function  40.89 
 
 		 480 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4556  hypothetical protein  36.67 
 
 		 495 aa  263  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3136  hypothetical protein  36.46 
 
 		 489 aa  254  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3408  hypothetical protein  36.64 
 
 		 488 aa  252  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  51.05 
 
 		 275 aa  249  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  50.42 
 
 		 275 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  50 
 
 		 287 aa  237  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  43.93 
 
 		 277 aa  210  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1679  hypothetical protein  32.84 
 
 		 466 aa  181  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487546  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6749  hypothetical protein  31.76 
 
 		 462 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2577  hypothetical protein  35.19 
 
 		 482 aa  179  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  36.82 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  38.29 
 
 		 691 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  36.82 
 
 		 427 aa  115  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  31.14 
 
 		 465 aa  100  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 907 aa  94.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3535  hypothetical protein  29.48 
 
 		 478 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 608 aa  93.6  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  30.47 
 
 		 686 aa  92  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  30.04 
 
 		 475 aa  91.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 		 394 aa  91.3  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.51 
 
 		 282 aa  89.7  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.51 
 
 		 252 aa  88.2  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.13 
 
 		 288 aa  86.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  36.6 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 1321 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4545  hypothetical protein  30.81 
 
 		 314 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  30.77 
 
 		 423 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0732  hypothetical protein  27.11 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  28.78 
 
 		 883 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  27.35 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.87 
 
 		 1694 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  29.38 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  35.54 
 
 		 588 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  31.77 
 
 		 289 aa  76.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 		 1332 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  31.73 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.14 
 
 		 627 aa  75.1  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  32.32 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 641 aa  72  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.77 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.43 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  29.21 
 
 		 291 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  29.21 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  27.23 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  29.65 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  26.11 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  24.71 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.1 
 
 		 1290 aa  67.8  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  25.83 
 
 		 328 aa  67.4  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  30.23 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  25.33 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.19 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.23 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  30.69 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  28.72 
 
 		 275 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  25.81 
 
 		 409 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  30.91 
 
 		 295 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  30.33 
 
 		 1059 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 		 694 aa  62.4  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.15 
 
 		 912 aa  62.4  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  25 
 
 		 277 aa  62  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2952  glycoside hydrolase family 16  26.13 
 
 		 258 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123961  hitchhiker  0.0028074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  32.24 
 
 		 286 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  26.73 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  24.59 
 
 		 263 aa  59.3  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2605  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  24.6 
 
 		 722 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3131  glycoside hydrolase family protein  32.2 
 
 		 291 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  27.94 
 
 		 238 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  31.93 
 
 		 346 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.67 
 
 		 328 aa  55.1  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.97 
 
 		 884 aa  55.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.72 
 
 		 290 aa  55.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 492 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.01 
 
 		 569 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.81 
 
 		 261 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  28.71 
 
 		 1028 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  27.15 
 
 		 313 aa  52.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3145  glycoside hydrolase family 16  30.29 
 
 		 300 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3037  glycoside hydrolase family 16  29.95 
 
 		 300 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0766336  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.95 
 
 		 306 aa  51.2  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 		 291 aa  51.2  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.65 
 
 		 819 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  30.23 
 
 		 1441 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  36.84 
 
 		 337 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  30.86 
 
 		 269 aa  50.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2950  hypothetical protein  32.45 
 
 		 285 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.483524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4126  glycoside hydrolase family 16  23.44 
 
 		 281 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0487272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>