12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3767 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3767  putative membrane protein of unknown function  100 
 
 		 480 aa  941    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1039  hypothetical protein  47.44 
 
 		 473 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4556  hypothetical protein  39.21 
 
 		 495 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  40.89 
 
 		 842 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3136  hypothetical protein  38.38 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2577  hypothetical protein  39.34 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3408  hypothetical protein  36.29 
 
 		 488 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6749  hypothetical protein  33.48 
 
 		 462 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1679  hypothetical protein  31 
 
 		 466 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487546  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3535  hypothetical protein  32.85 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0732  hypothetical protein  28.76 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0401  hypothetical protein  26.4 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>