13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1039 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  941    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3767  putative membrane protein of unknown function  47.44 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  42.41 
 
 		 842 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4556  hypothetical protein  38.17 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3136  hypothetical protein  37 
 
 		 489 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3408  hypothetical protein  35.73 
 
 		 488 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1679  hypothetical protein  36.89 
 
 		 466 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487546  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6749  hypothetical protein  31.97 
 
 		 462 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2577  hypothetical protein  35.2 
 
 		 482 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3535  hypothetical protein  31.34 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0732  hypothetical protein  28.84 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1693  hypothetical protein  27.51 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.310178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0401  hypothetical protein  39.19 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>