13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1693 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1693  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  926    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.310178  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1683  hypothetical protein  28 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0732  hypothetical protein  26.43 
 
 
495 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.475788  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3136  hypothetical protein  30.67 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3408  hypothetical protein  32.73 
 
 
488 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1039  hypothetical protein  27.51 
 
 
473 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475935  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2577  hypothetical protein  29.75 
 
 
482 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  24.57 
 
 
480 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0401  hypothetical protein  26.11 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  30.65 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  30.65 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4556  hypothetical protein  24.18 
 
 
495 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202391  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3767  putative membrane protein of unknown function  27.94 
 
 
480 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>