14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3408 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3136  hypothetical protein  83.37 
 
 		 489 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3408  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  959    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3767  putative membrane protein of unknown function  35.52 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  36.64 
 
 		 842 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1039  hypothetical protein  35.73 
 
 		 473 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2577  hypothetical protein  35.71 
 
 		 482 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4556  hypothetical protein  32.74 
 
 		 495 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6749  hypothetical protein  33.03 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1679  hypothetical protein  29.85 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487546  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3535  hypothetical protein  27.43 
 
 		 478 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0732  hypothetical protein  23.79 
 
 		 495 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1693  hypothetical protein  39.02 
 
 		 472 aa  50.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.310178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0401  hypothetical protein  36.71 
 
 		 457 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  33.96 
 
 		 557 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>