13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3535 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3535  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  941    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3767  putative membrane protein of unknown function  33.98 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1039  hypothetical protein  31.34 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3136  hypothetical protein  26.89 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3408  hypothetical protein  28.32 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4556  hypothetical protein  28.21 
 
 		 495 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6749  hypothetical protein  28.17 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2577  hypothetical protein  28.6 
 
 		 482 aa  97.8  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1679  hypothetical protein  29.85 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487546  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  29.51 
 
 		 842 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0732  hypothetical protein  27.55 
 
 		 495 aa  53.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1683  hypothetical protein  27.37 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0401  hypothetical protein  26.63 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>