104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1322 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1322  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  346  9e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 199 aa  262  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 258 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  35.96 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  27.98 
 
 		 225 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  27.98 
 
 		 225 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  27.98 
 
 		 225 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 265 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 218 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 213 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 239 aa  51.6  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 228 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 226 aa  51.2  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 234 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 250 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 278 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 225 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 240 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 223 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 208 aa  48.1  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 223 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 234 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 245 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  26.32 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4047  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 342 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 238 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 220 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 223 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 233 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  32.14 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  32.14 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  32.14 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 247 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 250 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 257 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 235 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 235 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 200 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 247 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 227 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 255 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 263 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 239 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 231 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  33.93 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2589  regulatory protein TetR  32.71 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 223 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3334  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 185 aa  41.2  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 207 aa  41.2  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 242 aa  41.2  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 249 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4913  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 222 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.763615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5002  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 222 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.827142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 242 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>