285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1640 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 337 aa  704    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  34.47 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  31.83 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  26.22 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.21 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 398 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 672 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 398 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 		 408 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.28 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.02 
 
 		 271 aa  92.4  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  24.26 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  29.31 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 353 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  26.26 
 
 		 352 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  24.65 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  26.81 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  24.51 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  25.9 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  29.46 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  25.08 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  26.33 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  24.12 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  41.05 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  34.09 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  34.09 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.28 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  24.03 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  33.58 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  39.5 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  42.27 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  37.11 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  26.12 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  23.6 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  22.92 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  22.87 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  23.42 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  37.14 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  31.58 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  23.22 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  29.84 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  40.45 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  23.42 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  36.78 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  36.19 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  34.58 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>